Dioscanna Séireaphroileála Ilfhachtóiriúla An Chuid a Chuireann Freagraí ar Choróinvíreas Daonna Reatha ar Dhíolúine SARS-CoV-2 (Cuid 2)
Jun 15, 2022
Chun tuilleadh eolais a fháil plz déan teagmháildavid.wan@wecistanche.com
Rún de ama antashubstaint dinimic le ABCORA ser-oprofilanga. Cros-ranntaanailís de imoibríocht antashubstainte i ndiaidh SARS-CoV-2diagnóis ag RT-PCR (N = 369) agusiar-thosaigh decomharthaí (N = 333) béim an acmhainn de ABCORA ser- oprofiling chun tosú, buaic agus laghdú SARS-CoV-2 a dháileadh antashubstaint freagraí (Fig. 5a, b, Forlíontach Fíor 11). I daoine aonair le a ar eolas dáta de fichéad Diagnóis SARS-CoV-2 RT-PCR nó comharthaí a bheith ag tosú, ABCORA 2.3 a bhratheag go luath séirea-thiontú-sion isteach 98 faoin gcéad (48de 49) agus100 faoin gcéad (9de 9) de daoine aonair laistigh7 laethanta iar-RT-PCR agus tosú na hairíonna, faoi seach. Thairis sin IgM agus Imoibríocht IgA, bhí freagraí IgG inbhraite go héasca i ABCORA 2.0 tar éis cúpla lá ionfhabhtaithe (ForlíonadhntaryFig. 11a).
Measúnú fadaimseartha ar chohórtde téarnamh othair suaschun 11 mhí tar éis an ionfhabhtaithe (251 tomhas ar 120 othair) aibhsitheanamadinimicde SARS-CoV-2 antasubstaintí ceangailteach. Mheasamar an meath of ceangailteach imoibríocht fostú acumhacht-dlí múnla measctha agus d'aithin sé rud suntasach dearggníomh isteach RBD, S1, agus N isteach go léir Ig subtypes (Fig. 5b) leleathshaol ag raon ó 67 chun 404 lá, le titers IgG N ag lobhadh an is tapúla,isteachlíneleroimhe tuarascálacha10. leath-saoltadean neodrachization ábhartha IgG freagraí chun RBD agus S1 bhí 125 agus 404 lá, faoi seach. Intriguingly, an cinéitic de neodrú antasubstaintí rinne ní scáthán an lobhadh rátaí breathnaíodh le haghaidh ceangailteach antasubstaintí. Tháinig laghdú overa ar ghníomhaíocht neodraithell ag a níos moilleráta, le a leath-saol 991 lá (Fig.5c). Bhí sé seo i bpáirt mar gheall ar ameascthaimoibríochtpatrúnleroinntdaoine aonairag taispeáintanméadú isteach neodrú ghníomhaíocht post dearfach SARS-CoV-2 RT- PCR5, agus tháinig meath tapa ar ghníomhaíocht neodraithe i gcásanna eile (Forlíontach Fíor 11c).
Éifeachtaí de HCV díolúine ar SARS-CoV-2 éadáil. Chun
imscrúdú a chumasú ar idirspleáchais idir réamh-existing immaontacht chun HCoV agus SARS-CoV-2 ionfhabhtú, againn leathnaithe anABCORA coirnín antaigin eagar chun áireamh S1 próitéiní de go léir ceithre cinn a scaiptear HCoVanna (HCV-NL63, HCV-229E, HCV- HKU1,HCV-OC43) (Suforlíontach Fig. 12a). De réir chun aacmhainn chun monatóireacht antasubstaintí chun five coróinvíris, againn dtugtar an mheasúnacht ABCORA 5.0 agus oilte agus bailíochtaithe é ar an céannacohóirt mar ABCORA 2.0 (Fig. 1). Chun comparáid dhíreach a cheadú le ABCORA 2.0 agusanúsáid de na samhlacha tuar neodrachta, táimidúsáidtear an tairseach-/Socruithe anailíse SOC-bhunaithe de ABCORA 2.0 freisin le haghaidh ABCORA 5.0. Bunaithe ar ABCORA 5.0 tomhas de oiliúint cohóirt I–III, againn Seiftithe dhá randamach foraoise-anailís bunaithe samhlacha. ANCORA 5.4 san áireamh amháin an 12 SARS-CoV{0}} paraiméadair, agus ABCORA 5.5 san áireamhd isteachbhreis an S1 HCoV tomhais ag cur suas le 24 paraiméadair san iomlán. In analaí leABCORA 2.3, corprú de HCV imoibríocht isteach an Mionsamhailbhí buntáisteach. ANCORA 5.Chuir 5 an íogaireacht is airde ar fáil agussonrafichathair i measc an anailís halgartaim tóraigh ABCORA 5.0 (Forlíontach Fíor 12b, Tábla Forlíontach 10).
Idirspleáchais idirantashubstaint imoibríocht chun an ceathair HCoVanna agus SARS-CoV-2 scáthánaithe Cad againn roimhe breathnaíodh
le haghaidh HKU1 le a go háirithe ard comhghaol de IgM imoibríocht de
SARS-CoV-2 agus HCoVanna isteach réamh-paindéim daoine aonair, go háirithe isteachsiúdlele déanaí HCV ionfhabhtú (ForlíontachFíor 13). Is minic a bhíonn ionfhabhtuithe HCV ach faoi réir séasúrachtaagusanleitheadúlacht de aonair HCV ionfhabhtuithe luctuates41,42. I líne leis seo, leitheadúlacht na bhfreagraí HCV tomhaiste ag ABCORA 5.0 isteach áitiúil fola deontóirí isteach Eanáir 2019 (N = 285), Bealtaine 2019 (N=288), agus Eanáir 2020 (N=252) éagsúilgo mór (Fig. 6). Chun chumasú a am-rialaithe comparáid a dhéanamh idir HCV imoibríocht idir SARS-CoV-2-ionfhabhtaithe agus deontóirí sláintiúil, againn scread fola deontóirí ó Bealtaine 2020 (N = 672), Cathain SARS-CoV-2 leitheadúlacht bhí measta faoi bhun 2 faoin gcéad i Zurich, Eilvéis43, le ABCORA 2.{{{0}}/5.0 agus fágadh gach sampla leis SARS-CoV-2 imoibríocht. Tá an iarmharach Bealtaine 2020cohórt (N=653)déanta a paindéim, sláintiúil deontóir smacht grúpa. Suimiúil,Difríocht idir patrúin imoibríochta HCV in 2019 agus 2020ered go substaintiúil mar mheas le aon-bealach ANOVA, le Eanáir 2020 ag taispeáint ani gcomparáid is ísle agus Bealtaine 2020 an airde IgA agus IgGimoibríochity, a féadfaidh cuir in iúl a níos déanaí tosaigh de an HCV eipidéim in 2020 i gcomparáid le 2019 (t-thástálacha Bealtaine 2020 i gcomparáid le tástálacha eile grúpaí sconas isteach Fig. 6).
An rud is suimiúla, anailís ama-mheaitseála comparáil BealtaineDeontóirí sláintiúla 2020 le SARS-CoV-2-sampla othar dearfachaleagipril, Bealtaine, agus Meitheamh 2020 (N = 65) nocht comharthaificantalach íochtairHCV imoibríocht isteach SARS-CoV-2 dearfach othair (Fig. 7a). seo patrún bhí freisin léir Cathain againn leathnaigh an anailís chun a chur san áireamh anláncohórtde SARS-CoV-2 daoine ionfhabhtaithe tomhaistele ABCORA 5.0 (N=389, sampláladh ó Mhárta 2020 go dtíFeabhra 2021, Forlíontach Fig. 14). Tríd is tríd, na torthaí seo isteachdiata go réamh-ann cheana imdhíonach freagraí chun HCoVanna féadfaidh chun a cosaint ar ionfhabht SARS-CoV-2 go pointe áiritheiar.


Cliceáil anseo chun tuilleadh a fhoghlaim faoi Cistanche
Fig. 5 Monatóireacht ama éabhlóid de antashubstaint freagraí. an ABCORA 2.3 sainmhíniú de seropositivity isteach deontóirí le dearfach RT-PCR dheimhnigh SARS- Ionfhabhtú CoV-2 agus dáta aitheanta RT-PCR (N = 369). Seropositivity rátáilfaoi plasma sampláil am pointeiar-dhiagnóis tá léirítear. Liath limistéar scáthaithe buaicphointí an ar dtús seacht laethanta ó shin dearfach RT-PCR bhrath. bCumhacht-dlí Mionsamhail, le am ó shin RT-PCR mar seasta éifeacht agus aonair mar éifeacht randamach, ag meastachán an lobhadh de gníomhaíocht cheangailteach antashubstainte bunaithe ar ABCORA 2.0 tomhais ag 1–4 phointe ama fadaimseartha i 120 duine san iomlán251 tomhasnts. Corcra línte comhfhreagras chun an samhail's meastachán aguscorcra-scáth ceantair chun an95 faoin gcéadmuinín eatraimh. Antashubstaint leath-saolta (t1/2 i laethanta) ó suntasach samhlacha bhfuil léirítear. Suntas bhí mheas ag baint úsáide as Satterthwaite comhfhogasú le haghaidh a dhá-taobh t-scrúdú ar an fána paraiméadair. c Cumhacht-dlí Mionsamhail, le am ó shin RT-PCR mar seasta éifeacht agus aonair mar a randamach éifeacht, ag meastachán an lobhadh de neodrú acmhainn ar 251tomhais ó 120 daoine aonair. Amháin daoine aonair le NT50 > 100ag a gcuid ar dtús tomhas bhí úsáidtear chun meastachán an leath-saol. Tá an corcra fhreagraíonn líne chun an Mionsamhail meastachán agus an corcra scáthaithe cheantar chun an95 faoin gcéadmuinín eatraimh. Suntas bhí mheas ag baint úsáide as comhfhogasú Satterthwaite le haghaidh a dhá-taobh t-scrúdú ar an fána paraiméadair.


Fig. 6 Séasúrach agus bliantúil flceint isteach HCV imoibríocht. Imoibríocht chun duine coróinvíris (HCV-NL63, HCV-229E, HCV-HKU1, HCV-OC43)bhí i gcomparáid le ABCORA 5.0. Imoibríocht isteach sláintiúil fola deontóirí ó 2019 agus 2020 bhí i gcomparáid. Réamh-paindéim samplaí san áireamh: Eanáir 2019 (N = 285), Bealtaine 2019 (N = 288), Eanáir 2020 (N = 252). Samplaí ó Bealtaine 2020 (N = 672) bhí bailithe le linn an paindéim isteach Eilvéis. Samplaí amháin sin SARS-CoV-2 sonrach imoibríocht mar sainithe le ABCORA bhí san áireamh (N = 653). Réaltaí comhfhreagras chun leibhéil de tábhacht de dhá-taobh t-tástálacha ag comparáid an in iúl grúpaí. Leibhéil de tábhacht bhfuil ceartaithe le an Bonferroni modh le haghaidh iolra tástáil agus in iúl mar leanas: *p< 0.05/36, **p < 0.01/36,="">p< 0.001/36.Ceapacha bosca ionadaíocht an leanas: airmheánach le an lár líne, Uachtarach agus íochtair ceathairíleanna le an bosca teorainneacha, 1.5x idircheathaireach raonta le an guairí, agus asluiteacha le pointí.
Éifeachtaí de HCV díolúine isteach SARS-CoV-2 ionfhabhtú. Chun
iniúchadh breise a dhéanamh ar idirspleáchais le himdhíonacht HCV, ní mór dúinnxtfiosraithe cibé acu HCV freagraí bhfuil nasctha chuig an éabhlóidde SARS-CoV-2 antasubstaintí. Chun seo deireadh, rinneamar anailís ar antashubstaintfreagairtí plasma de 204 duine a sampláil leisteach 60 laethanta i ndiaidh SARS-CoV-2diagnóis ag baint úsáide as samhail aischéimnithí líneach coigeartaithe le haghaidh aoise, inscne, agus ama ó dearfach RT-PCR, agus HCVimoibríocht. Chun srathú HCoV imoibríocht isteach ard agus íseal Gníomhaíocht HCoV, airmheánachMFI logáil isteach-FOE bhí deficurtha le haghaidh gach HCV agusantashubstaintaicme. LogMFI-FOE níos airde ná an comhfhreagrachairmheán le haghaidh ar a laghadt trí HCoVanna (HKU1, OC43, NL63, nó 229E) go sonrachc Ig aicme bhí rangaithe mar ag ard HCV ghníomhaíochtlaistigh den rang seo. Gcéad dul síos, imoibríocht ach amháin i measc na frith céannaboidisrang were iniúchadh isteach an Mionsamhail (i.e., HCV IgG ard ar SARS- CoV-2 IgG). Thugamar faoi deara eisceachtlíláidiridirspleáchais le haghaidh IgA agus IgM freagraí chuig SARS-CoV-2, ago léirbhícomharthaificantalachníos airdeisteachdaoine aonairleard HCVimoibríocht (Fig. 7b). seo molann sé go láidir go bhfuil HCV ann cheana féin féadfaidh díolúine a sholáthare an buntáiste isteach gléasta SARS-CoV-2 freagraí.Idirspleáchais idir HCV IgG agus SARS- CoV-2 níor breathnaíodh IgG ar leith ach amháin don fhreagra S2. Rud suimiúil, ag tacú leis an gcinneadh seo, tá HCV S2 heilp freagraíbhí le déanaí fuarthas chun treisiú SARS-CoV-2 díolúine, isteachar leith Gníomhaíocht antasubstainte S231. Chun féachaint an bhfuil cead ag SARS-CoV-2 IgGthógáil ar le déanaí HCV IgA agus IgM freagraí againn seo chugainn tóraighcibé an bhfuil HCV IgM agus IgA nasctha le elevoted SARS-CoV-2 sonrafic IgGleibhéil.Cé nár léir aon éifeacht do IgM, táimid chonaic comharthaificant Comhlachas de ard HCV IgA ghníomhaíocht argo léirceathairtomhaiste SARS-CoV-2 freagraí (Fig. 7c, d). seo le fios go láidirgole déanaí HCV ionfhabhtú táa beinnficial éifeacht ar fhreagra antashubstainte SARS-CoV-2 a fheistiúses.
I an seo chugainn anailís, againn tóraigh dá réamh-ann cheana HCV díolúinetá an tionchar ar dhéine an ghalair i COVID- 19. Chuige sin, táimidtóraigh HCoV díolúine isteach 80 san ospidéal agus neamh-ospidéaldaoine aonair ionfhabhtaithe le haghaidh níos lú ná 30 lá (Fig.8a). Rialú le haghaidh aois agus inscne, fuair muid amach go bhfuil daoine aonair a bhfuil High réamh-ann cheana Bhí imoibríocht HCV suntasachseangíochtair DDSchuncheangalospidéal (loighisticeaischéimniú NÓ = 0.16, 95 faoin gcéad CI (0.04, 0.67), Fíor.8b, Forlíontach Fíor 15). Sraith eileifiiarratas depaigne le cibé acu siad ag teastáil cóireáil ag an ICU léirigh a laghdaigh an dóchúlacht go patients le ard HCoV freagra rátaí ag teastáil ospidéal le dian cúram (ordamhail aischéimniúNÓ {{0}}.36, 95 faoin gcéad CI (0. 13, 0.96), Fíor.8b, ForlíontachFig. 15). Dá bhrí sin, daoine aonair le ard HCoV leibhéil bhí a 6Laghdaigh 4 faoin gcéad na corrlaigh de cheangal san ospidéal de réir nódiail céim anailís aischéimnithí ag comparáid san ospidéal isteach rialta bardaí, isteach ICU, agusneamh-ospidéald daoine aonair (Fig. 8a, b). Le chéile, iad seo tugann tuairimí go láidir le fios go bhfuil éifeacht thraschosanta annof HCVdíolúine maidir le múnlú na cosanta imdhíonachta i gcoinne SARS-CoV-2.



Fig. 7 Éifeachtaí de réamh-ann cheana HCV díolúine le linn SARS-CoV-2 éadáil. a Am-comhoiriúnaithe comparáid de ABCORA 5.0 imoibríocht le haghaidh SARS-CoV-2agus HCoVanna isteach sláintiúil agus SARS-CoV-2 ionfhabhtaithe daoine aonair. sláintiúil deontóirí bhí sampláladh isteach Bealtaine 2020 (N = 653; gorm). Plasma ó SARS-CoV-2 duine ionfhabhtaithes bhí bailithe idir Aibreán–Meitheamh 2020 (N = 65; dearg). Féach Forlíontach Fig. 14 le haghaidhananailís de an lán SARS-CoV-2 dearfach cohórt(N = 389). Liath boscaí cuir in iúl luachanna os cionn an aonair MFI-FOE gearrtha-seachrán le haghaidh SARS-CoV-2 sonrach freagraí le haghaidh gach antaigin. Réaltaí comhfhreagras go leibhéil de tábhacht de dhá-taobh t-tástálacha ag comparáid diúltach in aghaidh dearfach othair. Leibhéil de tábhacht bhfuil ceartaithe le an Bonferroni modh le haghaidh iolrach tástáil agus in iúl mar leanas: *p< 0.05/12, **p< 0.01/12, ***p< 0.001/12 (IgG HKU1: p = 0.66, IgG OC43: p = 0.45, IgG NL63: p=3.3 × 10−04, IgG 229E: p = 1.6 × 10−05, IgA HKU1: p=1.8 × 10−03, IgA OC43: p=1.3 × 10−05, IgA NL63: p=1.4 × 10−07, IgA 229E: p=3.0 × 10−05, IgM HKU1: lch = 3.3 × 10−08, IgM OC43: p = 4.3 × 10−03, IgM NL63: p = 1.1 × 10−07, IgM 229E: p = 2.7 × 10−02). Ceapacha bosca ionadaíocht an leanas: airmheánach le an Lár líne, Uachtarach agus íochtair ceathairíleanna le an bosca teorainneacha, 1.5x idircheathaireach raonta le an guairí, agus asluiteacha le pointí. b Líneach aischéimniú samhlacha ag taispeáint an Comhlachas idir SARS-CoV-2 agus HCV comharthaí isteach 204 SARS-CoV-2 dearfach othair le ar eolas dátaí de chéad dearfach RT-Brath PCR. Tionchair laistigh an céanna antashubstaint aicme bhfuil fiosraithe. Tá an samhlacha bhí coigeartaithe ar aois (splíne le 3 céimeanna de saoirse), inscne, am ó shin dearfach RT-PCR (splíne le 3 céimeanna de saoirse), agus leibhéal de HCoV imoibríocht. Samplaí bhfuil deartha chun chuain ard HCV imoibríocht dá siad Taispeáin ABCORA 5.0 HCVMFI logáil isteach-FOE luachanna níos airde ná an comhfhreagrach airmheánach isteach ag laghad 3 HCoV tomhais (HKU1, OC43, NL63, nó 229E). Freagraíonn curves chun an samhail's meastachán agus scáthaithe ceantair chun an95 faoin gcéadmuinín eatraimh. p-luachanna bhí faighte le ag rith a dhá-taobh Dalta t-scrúdú ar an paraiméadar bainteach le HCV imoibríocht isteach an líneach aischéimniú. c Líneach aischéimniú Mionsamhail ag taispeáint an Comhlachas idir SARS-CoV-2 IgG agus HCV IgA comharthaí. Curves comhfhreagras chun an samhail's meastachán agus scáthaithe ceantair chun an95 faoin gcéadmuinín eatraimh. p-luachanna bhí faighte le ag rith a dó-taobh Dalta t-scrúdú ar an paraiméadar bainteach le HCV imoibríocht isteach an líneach aischéimniú. d Líneach aischéimniú Mionsamhail ag taispeáint an Comhlachasidir comharthaí SARS-CoV-2 IgG agus HCV IgM. Freagraíonn curves le meastachán an tsamhail agus limistéir scáthaithe go dtí na heatraimh muiníne 95 faoin gcéad. p-luachbhí s faighte le ag rith a dhá-taobh Dalta t-scrúdú ar an paraiméadar bainteach le HCV imoibríocht isteach an líneach aischéimniú.
Pléighian
Defináisiún de SARS-CoV-2 díolúine iar-vacsaíniú agustá tábhacht láithreach ag ionfhabhtú44–46. Deciphering frithcomhlachtcomhghaolde SARS-CoV-2 cosaintagusmonatóireacht vacsaín is tascanna dúshlánacha iad freagrúlacht. An méid and fad saoil de cosanta antashubstaint freagraí chun nádúrtha ionfhabhtú agus difriúil vacsaíní riachtanas chun bheith scrúdaíodh chun thuiscintparaiméadair go cruth cosanta freagraí agus cinntí a threorú maidir le hathvacsaíniú i measc neamhfhreagróirí agus imdhíonadh againstúrscéal ag éirí SARS-leagan CoV-247. Mar an gcéanna, modhanna a chruthú chun idirdhealú séireolaíoch idir ionfhabhtú de novo, reionfhabhtú,agus vacsaín freagraí, a gcuid marthanacht agus teipeanna beidh fananncriodálach le haghaidh cliniciúil diagnóis.
Anseo againn léiriú an ard fóntais de il-paraiméadar ser- tairbheach maidir le dul i ngleic le heochaircheisteanna i defining SARS-CoV-2 díolúine. Comhuaineachbhrathde freagraí antasubstainte ar a raonde SARS-CoV-2 antaiginíagusdifriúil Igrangannale ABCORA seroprofilangachuir sé pictiúr cuimsitheach ar fáil de Stádas séireolaíochta SARS-CoV-2 i scrúdú amháin, a can a bheith úsáideach le haghaidh diagnóis chliniciúil chun láithreacht e a chinneadhof reinfection, definereinfection, agusfreagrachunvacsaíniú. Ríomhaireachtúilsamhaltúfreisinceadaitheag tuar plasma neo-réadú acmhainn ó ABCORA torthaí, chumasú acuimsitheach measúnú de SARS-CoV-2 antashubstaint dinimic agus a gcuid idirghníomhú leHCV freagraí. muid staidéar dhá ABCORA measúnachtleaganacha thag araon tomhaiste HCV imoibríocht taobh le an 12 SARS-CoV-2 paraiméadair.Áiríodh le ANCORA 2 antaigin S1 deHKU1. ANCORA 5 san áireamh S1 de go léir ceathair ag scaipeadh HCV.Go háirithe, ríomhaireachtúil samhlacha go san áireamh an HCVtomhais ceadaithe a níos airde cruinneas isteach ag cinneadh SARS-CoV- 2 seropositivity, ardsoilsiú idirspleáchais idir HCoVagus SARS-Freagraí CoV-2 nach mór a réiteach.
Taifeadadh imoibríocht in aghaidh go léir ceathair HCoVanna isteach SARS-CoV-2gan ionfhabhtú agusionfhabhtaithedaoine aonairagainnbreathnaíodhiontachcumainn. Uionfhabhtaithedaoine aonairar taispeáintníos airde HCVimoibríocht i gcomparáid le daoine aonair ionfhabhtaithe le tuiscintaranníocaíocht de HCV díolúine chun go luath cosanta in aghaidh SARS-CoV- 2. D’fhéadfadh tionchar dearfach a bheith ag imdhíonacht HCV ar SARS-CoV-2 freisinionfhabhtú. I comhaontú le eile tuarascálacha, againn faoi deara atras-bheathú de SARS-CoV-Freagraí 2 agus HCV in ionfhabhtú SARS-CoV-231,48 le daoine aonair le ard HCV imoibríocht forbairt-oping níos airde SARS-CoV-2 antashubstaint leibhéil. an chuid is mó go háirithe, a bhí ann cheana HCV díolúine bhí an tionchar ar galar déine inár cohórt. SARS-CoV-2 ionfhabhtaithe daoine aonair le íseal Imoibríocht HCV bhí a níos airde cosúlacht de á cheangal ospidéal.
Cé goárstaidéarfreagairtí antashubstainte amháin a thomhaistear, apoitéinsealcosantaéifeachtde HCoVdíolúine i gcoinne SARS-CoV-2 éadáil ba chóir ní bheith amharcmarsrianta chun gníomhaíocht antasubstainte. Antasubstaintí agus féadfaidh imdhíonacht cheallacha a bheith ábhartha araonagus gníomhach i gceolchoirm31,49–51. De rogha air sin, freagraíonn antasubstaintístámeasured isteach an i láthair staidéar féadfaidh amháin doiciméad le déanaí HCV ionfhabhtún agus seachadta a ionaid tomhas de eile cosantaHCV freagraí. Tá an nasc idir níos airde HCV agus SARS-CoV-2 imoibríocht i ndaoine atá ionfhabhtaithe tá sé thar a bheith suimiúil. An láidre éifeachtaí bhí feicthe le haghaidh IgM agus IgA HCoV freagraí, sugag iompar go le déanaí HCV díolúine soláthraíonn an go luath treisiú chun Forbairt antashubstainte SARS-CoV-2ent. Cibéseotádlitechun freagraí tras-imoibríocha cille B ar aan SARS-CoV-2díolúine Tógann ar agus aibíonn nó cibé acu cros-imoibríoch T cúntóirgníomhaíochtaíimirtról ceannasach mar a mholtar31 Beidh tábhachtach chun réiteach isteach amach-ag teacht staidéir. Tá an ról cruinn agus timing de HCoVfreagraíag tionchar SARS-CoV-2 antashubstaintfreagraí freisin fanann chun bheith deficurtha. Luath íseal-affinocht Freagraí HCoV féadfaidh agat a dearfach tionchar ar an Forbairt de SARS-CoV-2 díolúine trí chuimhne imdhíonachta a fhoirmiú ar a bhfuil chun thógáil, cé aimplifiiarratas de neamh-cosantatras-imoibríochHCV antibodies de réir chun an antaigineach peaca prionsabal féadfaidh agat éifeachtaí diúltacha30.
Cé goComhlachasní féidir le staidéir ar nós ár gcuid staidéir go foirmiúil define cúisíocht, an impleachtaí de ár is léir na torthaí: Roimhedíolúine chun HCV féadfaidh chosaint chun roinnt fairsinge in aghaidh SARS-CoV-2 éadáil, agusféadfaidh sholáthar a treisiú chun an Forbairt de SARS-CoV-2 sonrafic díolúine agus le seo íochtair an riosca le haghaidhdianospidéal. A measarthaéifeacht chosanta HCoVdíolúine bheadh bheith a sochreidte míniú le haghaidh an ardcomhréirde aimpéartomach agus éadrom SARS-CoV-2 ionfhabhtuithe52,53. Fiú níos mó tá peirspictíochtaí suimiúla amach anseo. Mar dhaoine eile agus muidagat léirithe, SARS-CoV-2 agus HCV díolúine chun ionfhabhtú bhfuilgo minic ní fada-buan (Fig. 5, Forlíontach Fig. 11)5,54, teorannúgo SARS-CoV-2 vacsaínídóchaschunshárú. Ba chóir SARS-CoV-2 freagraíisteachcassholátharméid cosanta in aghaidh HCV ionfhabhtú, leathan cosaint in aghaidh coróinvíris féadfaidh sé a bheith i rgach.


Fig. 8 Tionchar de HCoV díolúine ar COVID-19 déine. a Comhlachas de ospidéal stádas (ní san ospidéal (N = 16); san ospidéal ní isteach ICU(N = 42); san ospidéal isteach ICU (N = 22)) agus ard nó íseal IgG HCoV imoibríocht. Dronuilleog méideanna comhfhreagras chun an comhréir de san áireamh othair. b Tionchar na HCoV imoibríocht (íseal/ard) ar an ospidéal stádas isteach a fothacar de N = 80 othair, mar measta le corr cóimheasa, isteach an ordamhail aischéimniú (le leibhéil = ní san ospidéal (N = 16); san ospidéal ní isteach ICU (N = 42); san ospidéal isteach ICU (N = 22)) agus a loighistice aischéimniú (tagairt = ní san ospidéal(N = 16); in aghaidh go léir san ospidéal (N = 64)). Sonraí tá i láthair mar paraiméadar meastachán agus a95 faoin gcéadmuinín eatramh. Leibhéal de suntas de an paraiméadar tá faighte le a dhá-taobh t-scrúdú (p-luach tá ar taispeáint dá <>a mhalairt in iúl mar n.s.).
Misenós
Duine eiseamal. Séiream agus bailíodh samplaí plasma roimh theacht chun cinn agus i ndiaidh theacht chun cinn
SARS-CoV-2 isteachEilvéis (réamh agusiar-Feabhra 2020, faoi seach) bhísan áireamh. Níl othar rollú bhí stiúradh le haghaidh an i láthair staidéar. Gachturgnaimh ag baint samplaí ó duine deontóirí bhí stiúradh le ceadú ó na freagraíéagmais áitiúil eitic coiste (Ceann Trá Ethikkommission) Zurich,
Eilvéis (BASEC Nrs 2020-01327, 2020-00363; 2021-00437; 2020-00787), le an forálacha de an Dearbhú de Heilsincí agus an Cliniciúil Dea Cleachtadh treoirlínte de an Chomhdháil Idirnáisiúnta ar Chomhchuibhiú. Samplaí bhí faighte ó na foinsí seo a leanas: (i) Deonú fola Zürichseirbhstá (ZHBDS): Gan ainm sláintiúil fásta plasma ó réamh-paindéim ampointí (Eanáir 2019, Bealtaine 2019,agus Eanáir 2020) agus ón gcéad tonn den paindéim i Zurich, an Eilvéis (Bealtaine 2020) bhí ar fáil le an ZHBDS inmheánach stór serum agus míbhuntáistíent le haghaidh seo staidéar bhí tharscaoileadh le an eitic coiste(BASEC 2021-00437). (ii) Gan ainm eiseamail atá fágtha ó ghnáthdhiagnóisic ag an Institiúid de Leighis Víreolaíocht, Ollscoil de Zurich, an Leanaí na hOllscoile Ospidéal Zurich, agus an Cantonal Ospidéal Gheimhridh (BASEC Nrs2020-01327, 2021-00437). Fuarthas toiliú feasach i scríbhinn ó na rannpháirtithe go léira sampla was tógtha le linn an paindéim ag an Ollscoil OspidéalZurich (BASEC 2020-01327). Le haghaidh samplaí paindéime ó ospidéil eile agusd réamhpaindéim samplaí toiliú bhí tharscaoileadh le an eitic coiste. (iii) Cúram Sláintedheimhnigh oibrithe le RT-PCR go bhfuil SARS-CoV-2 ionfhabhtaitheian rannpháirteach isteach a staidéar ag an Ollscoil Ospidéal Zurich (BASEC 2020-00363). Scríofa eolasach toiliú bhí faighte ó go léir rannpháirtithe. (iv) Fireann plasma deontóirí rannpháirteach isteach a SARS-CoV-2 plasma teiripe staidéar a rinneadh ag an Ospidéal Ollscoile Zurich(CPT-ZHP, Swissmedic 2020TpP1004; BASIC 2020-00787). Scríofa ar an eolasfuarthas toiliú le haghaidh taighde ó na rannpháirtithe go léir. Tsé tuairisceoireachta de go léir duine agus patient sonraícomhlíonann leanSTROBE ráiteas. Réamh-paindéim (SARS- CoV-2 diúltachve, N = 825) agus confirmed SARS-CoV-2 dearfach samplaí (N = 389)bhí roinnte isteach oiliúint agus bailíochtú cohóirt (Forlíontach Tábla 3). Déimeagrafaic atá ar fáil data ar inscne, aois, am ó shin dearfach RT-PCR agussimptom tosaigh, agus ospidéal stádas bhfuil tuairiscithe isteach Forlíontach Tábla 11.Tá an SARS-CoV-2 oiliúint cohórt (N = 175) plasma a bailíodh le linnionfhabhtú (N=114) agus téarnamh (N=61). Per donóir amháin aon sampláil ambhí pointe san áireamh, longuta samplaí de deontóirí san áireamh isteach an oiliúint cohórt a bhí ní san áireamh isteach an bailíochtú cohórt neamhspleáchas a fhionnadh cathainag measúnú an íogaireacht agus sainiúlacht na modhanna diagnóiseacha éagsúla. Tá an SARS-CoV-2 bailíochtú cohórt (N = 214), comhdhéanta plasma bailithe le linn ionfhabhtú (N = 90, pointe ama samplála amháin in aghaidh an deontóra) agus téarnamh
(N = 124, 79 othar téarnaimh le 1-4 sampla fadaimseartha). Il-ampointí de téarnamh othair bhí san áireamh isteach an tacar sonraí bailíochtaithe chun gabháil a speictream leathan waning antashubstaint titers. A trasghearrtha anailís bhí bunaithe arsamplaí le ar eolas am ó shin dearfach RT-PCR (N = 369) nó ar eolas am ó symptom tosaigh (N = 333), lena n-áirítear na breathnuithe fadaimseartha anailíse.An dá, am ó dearfach RT-PCR agus amó shin tosaigh bhí ar eolas le haghaidh330 sampla, le ham airmheánach de thrí datá idir symptom tosaigh agus RT-PCR(1st–3rdceathairíl: 1–7 lá). Bunaíodh anailís fadaimseartha ar imoibríocht antashubstainte ar 251 breathnadóireacht as 120 dronnachcent othair le ar eolas am ó shin dearfach RT-PCR agus an t-am ó thosaigh na siomptóim. Neodrú was tomhaiste ar 467 SARS-CoV-2 RT-PCRdearfach samplaí (N = 369 le ar eolas am ó shin dearfach RT-PCR, N = 333 le ar eolas am ó shin symptom tosaigh).
Rinneamar measúnú breise ar thras-imoibríocht ABCORA 2.0 agus 5.0 ar chlét-thar plasmaó ghnáthdhiagnóisic i ngrúpa rialaithe réamhphaindéimeach with doiciméadaithe, HCV le déanaí ionfhabhtú (Traenáil II, N = 75; OC43 (N = 27), HKU1 (N = 17), NL63 (N = 22), 229E (N = 9)). Scaipeadh HCV tá coitianta amháin scread le haghaidh isteachsan ospidéal, ionfhabhtuithe tromchúiseacha riospráide agus imdhíon-i mbaol daoine aonaira théann faoi ghnáth broad scagadh le haghaidh riospráide ionfhabhtuithe. Uaidh sin, isteach an t-othar seo grúpa, araon laghdaithe antashubstaint imoibríocht dlite chun imdhíonach ag comhréiteach nóHCV ardaithe antibody imoibríocht dlite chun le déanaí nó athfhillteach HCV ionfhabhtú féadfaidhtarlú. Toisc go bhfuil an grúpa seo diagnóisgo stócach ábhartha againn mheas é stuama chun seo san áireamh cohórt mar Traenáil II sonraí leagtha chun fhíorú dá cros-imoibríocht le SARS-CoV-2 isteachABCORA tharlaíonn sa socrú seo. Níor cuireadh sonraí Training II san áireamh sa tairseach defináisiún chun ní thar-ionadaíocht daoine aonair le tinneas trom. Seo HCV-ionfhabhtaithegrúpa ar taispeáint tríd is tríd íochtair imoibríocht le SARS-CoV-2 ná plasma ósláintiúil daoine fásta ach tábhachtach léirigh níl tásc de tras-imoibríocht (Fíor.1a, b). Samp Paindéimeachles ó gan ainm fola deontóirí le anaithnid SARS-CoV-2stádas bailithe isteach Bealtaine 2020 (N = 672) bhí ní san áireamh isteach oiliúint agus bailíochtú cohóirt.
Imoibrithe agus línte cille. Bhí a-tag dul in aois SARS-CoV-2-díorthaithe antaiginí (gabhdóir
fearann ceangailteach (RBD), fo-aonad S1 (S1), fo-aonad S2 (S2), núcleocapsid próitéin (N)) agus S1 de tsé ceathair ag scaipeadh HCoVanna (HKU1, OC43, NL63, 229E) bhí ceannaíodh ó Sino Bitheolaíochta Europe GmbH, Eschborn, an Ghearmáin (ForlíontachTábla 12). Foinsí, sonraíochtaí, agus tiúchan na n-antasubstaintí braite agus rialaithe agus sera a úsáidtear le haghaidh ABCORA agus tes neodraithets bhfuil liostaithe isteach Tábla Forlíontach 13. 293-Fuarthas cealla T ón mBailiúchán Cultúir de Chineál Meiriceánach(ATCC CRL- 11268)55. Ht1080/ACE2cl. 14 cealla33 bhí cineálta curtha ar fáil ag P.Bieniasz, Rockefeller Ollscoil, NY. An dá cill línte bhí saothraithe isteach DMEMcoimeáding10 faoin gcéadFCS.
Dearadh de ilphléacs coirnín measúnacht ABCORA 2.0. muid bunaithe dhá coirnín-bunaitheilphléacsáilte SARS-CoV-2 tástálacha imdhíonachta (ABCORA 2.0 agus ABCORA 5.0) goáiríodh raon SARS-CoV-2 agus HCoV antaiginí (Sino Bitheolaíoch EoraipGmbH, Eschborn, an Ghearmáin, Tábla Forlíontach 12). Ceithre anta SARS-CoV-2ns- RBD, S1, S2, agus N - bhí san áireamh isteach araon ABCORA 2.0 agus ABCORA 5.0.ANCORA 2.0 san áireamh isteach bhreis S1 de HCV-HKU1, agusABCORA 5.0 san áireamh S1de go léir ag scaipeadh HCoVanna (HCV-NL63, HCV-229E, HCV-HKU1, HCV-OC43). I gairid, aonair MagPlex coirníní (Luminex corparáid, Aibhistín, TX) le uniqú fluaraiseacha coirnín réigiúin bhí roghnaithe le haghaidh gach antaigin, coirníní bhícúpláilte agus meascáin de choirnín antaigin-chúpláiltesbhígortha le othar plasma isteach a 96-go maith pláta leagtha-suas. Tá anAirmheánach Fluaraiseacha Déine (MFI) de plasma faoi cheangal coirníníantabboladh bhí tomhaiste ag baint úsáide as a FlexMap 3D léitheoir (Luminex corparáid,Aibhistín, TX). muid deartha an measúnacht chun fulfill an leanas critéir: (i) ard luas-cifichathair, íogaireacht, agus in-atáirgtheacht, (ii) solúbtha ilphléacs dearadh go Ceadaíonn simplí bhreis agus/nó athrú de antaiginí; (iii) leathan dinimiciúil raon; (iv) roghnach cainníochtafiiarratas de antashubstaint freagraí; (v) roghnach taifeadadh defrith-chorpfreagraí ar HCoVanna agus (vi) úsáid de réir a chéilene diagnóisic agus taighde.
Roghnaigh muid sterical treoshuíomh gabháil tríd frith-Bhí a chuid antasubstaintí chun chinntiú a taispeáint antigen aonchineálach. Mar sin, tá M. carboxylatedagPlex coirníní (Luminex
corparáid, Aibhistín, TX) bhí cúpláilte le frith-Bhí a chuid antashubstaint (Sino Bitheolaíoch
Eoraip GmbH, Eschborn,Ghearmáin, Tábla Forlíontach 13) agus ansin cúpláilte le His-taggedantaiginí ag baint úsáide as Bith-Plex Amín cúplála (Bith-Rad SaotharlannaAG, Cressier, an Eilvéis) de réir itreoracha agus marcur síos56.
Meastar go ginearálta gurb é toirtmheascadh serum/plasma an tsraith is cruinneteigí chunretrioíche roimh cainníochtúil eolas ar antashubstaint imoibríocht. ach, isteach diagnóisic úsáidtástálacha go hidéalach ba chóir seachadta (leath)-cainníochtúil eolas ó a serum amháincaolú chun cead tréchur leordhóthanach. Clúdaíodh na coinníollacha measúnaithe críochnaithe a 2-log raon MFI ar fud na teaglaim antigen-Ig tástálaithe (Fíor Forlíontach 1).Daingniú an bailíocht de ag baint úsáide as a singil plasma caolú, againn confirmed go plasmaó SARS-CoV-2 dearfach othair agus réamh-paindéim SARS-CoV-2diúltachLéiríonn samplaí plasma an dáileog-fhreagairt is fearr cuair thar a leathan plasma caolúraon (Forlíontach Fig. 1f). Tábhachtaí fós, a 1/100 caolú de plasma bhí isteach go léircásanna dhúnadh go dtí an comhartha uasta, ag cur béime ar an plasma méadaithe sinní mhéadódh tiúchan déine na comhartha ach go gcuirfí i mbaoler ag laghdúsignásanna dlite chun prósón éifeachtaí (Forlíontach Fig. 1f).
Uasmhéid frith-Bhí a chuid antashubstaint ag lódáil bhí bainte amach ag 5 µg antashubstaint in aghaidh milliúncoirníní (Forlíonadhiontráil Fig. 1c) agus úsáidtear mar a caighdeánach cúplála riocht. I an finailprótacal,Goradh cúig mhilliún frith-a coirníní maighnéadacha cúpláilte antasubstainte Bhí a chuid-tagaithe antaiginí caolaithe i PBS ag tiúchan 320 nM.antasubstaintí tánaisteacha lipéadaithe Phycoerythrin (PE) atá sonrach do IgG, IgA, nó IgM bhía úsáidtear mar antasubstaintí braite (ForlíontachTábla 13). Cáilíocht smacht de anantaigin loaging bhí léirithe le goir an coirníní le monaclónachantasubstaintí a dhíríonn ar an CoV-d comhfhreagrachéirig antaigin mar mionsonraithe isteachTábla Forlíontach 12. Rinneadh anailís le hinsinth an FlexMap 3D léitheoir(Luminex Corporation, Aibhistín, TX) le an éadáil de ag laghad 50 coirníní in aghaidhréigiún coirníní. Torthaí aath thaifeadta mar MFI in aghaidh coirnín réigiún.
Cuireadh roinnt beart rialaithe installa chun fhionnadhidir-agus laistigh-measúnachtfeidhmíocht. Chun measúnú íseal-go- a fháil amachmeasúnacht inathraitheacht, mór baisceanna deaonair antigen-luchtaithe bcluasa bhí ullmhaithe agus reoite isteach slánchuid go dtí úsáidtear ag-20 céimC chun timpeallanlobhadh de an antaigin-cúpláilte coirníní (Fíor Forlíontach. 1). Meascadh coirníní cúpláilte aonair ar lá na tástála go dtí yiáird an ag teastáil antaigincocktail coirnín. Bhí 60 coirníní i mhanglaim lcher coirnín réigiún in aghaidh µl. I bhreis chunna réigiúin coirníní SARS-CoV-2 agus HCV, chuimsigh gach manglam fuascailty réigiún coirníní (níl antaigin cúpláilte) chun smacht le haghaidh neamhshonraithefic ceangailteach. Cáilíocht rialú agus bailíochtú nósanna imeachta le haghaidh an FlexMap 3D ionstraim bhí déanta ar gach lá de naturgnamh accordú chunanmonaróir's treoracha. Tá an inathraitheacht de an measúnachtbhí anailís mar leanas56: plasma samplaí ó 20 RT-PCR confirmed SARS-CoV- Rinneadh 2 othar ionfhabhtaithe a chomhthiomsú agus a thástáil oleagan a raon de seacht caoluithe isteach 31 éagsúla tatriallta léirithe ar 10 difriúil laethanta (Forlíontach Fig. 2). trasnago léir antaiginí agus Ig ranganna, comharthaí bhí coinnithe thar an scrúdú tréimhse de 25lá post cúplála coirníní. Comhéifeachtaí éagsúlachta (CV) an chomhartha ceangailteach trasna tatrialltaden 12 rang antigen-Ig combináisiúin chruthaigh íseal (raon: 0.010–0. 128, airmheánach 0.059, Fíor Forlíontach 3c, d, Táblaí Forlíontacha 1, 2). Lá céanna agus lá go láinathraitheacht lchroved íseal agus inchomparáide (Forlíontach Fig. 3e, f). Thíos a 1/ 100 plasma tiúchan, CV méaduithe go suntasach (Forlíontach Fíor 3d), ag sainmhíniú 1/100 mar an tiúchan is airdear (is ísle plasma caolú) chun bheith thástáil isteach an measúnacht. Sainmhíníodh caolú plasma 1/100 mar an bunúsachcaolú le haghaidh scagadh plasma isteach ABCORA 2.0 Cathain a cáilíochtúil (.i. SARS-CoV- a bheith i láthair nó a bheith as láthair). 2antashubstaintí sonracha) nó leathchainníochtúil (ie, déine comhartha MFI) israg teastáil.
Bhí gach tomhas ABCORA desracadh ó singil tomhais mura rud éluaite a mhalairt. Chun SARS-CoV-2 sonraigh a thomhasc antasubstaintí isteach othar plasma,teas-dhíghníomhaithe plasma (1 h ag56 céimC) bhí caolaithe 1/100 isteach PBS-BSA1 faoin gcéadmura rud éa mhalairt ráite. 50 µl caolaitheeag plasma bhí gortha le 50 µl de an ABCORAantaigin coirnín cocktail le haghaidh 30 nóiméad ag seomra teocht isteach 96-plátaí tobair, nite trí huaire le PBS-BSA 1 faoin gcéad , agus gor i imoibrithe ar leith wiú phycoerythrin (Corpoideachas)-lipéadaithe brathadóir antasubstaintí le haghaidh IgG, IgA nó IgM ag a fitiúchan nal de 1/500 i PBS-BSA 1 faoin gcéad . Ba é an caolú seo a shainmhínigh roimhe seotoirtmheascadh ar antasubstaintí braite chun na comharthaí MFI is fearr a bhaint amach. Tar éis 45 minutes degoir ag teocht an tseomra, nitear coirníní trí huaire le PBS-BSA1 faoin gcéadagus anailís isteach 96-go maith plátaí ar an léitheoir FlexMap 3D (Luminex Corporation, Austin, TX). A íosta de 50 coirnín léann in aghaidh antaigin bhí faighte.
Chun rialú a dhéanamh le haghaidh fíor-antasubstaint tras-imoibríochí, gach plasma sampla bhímeasúnaithe le beads sin antaigin (folamh coirnín smacht) isteach teaglaim agach brathadóir antibody. Le haghaidh anailís, amh MFI luachanna bhí claochlaithe chun MFI-FOE chun ceart le haghaidh chúlra ceangailteach.Bhunaíomar coirnín meánach MFI-FOE le haghaidh IgG, IgA, agus IgM deontóirí sláintiúla réamhphaindéimeacha (N=1016) agus set an meán MFI-FOEmóideDiall caighdeánach 4x mar an tairseach le haghaidh rialú coirníní folamh.I iomlán leibhéil, iad seo tairseacha méid chun MFI-FOE 41.58 (IgG), 55.91 (IgA), agus 269.47 (IgM).Méascaíochtaí le haghaidh a an folamh coirnín smacht thaifeadta luachanna abúve seo tairseach bhí mheas neamhbhailí agus arís agus arís eile.
Socraíodh gach pláta tobair 96-anailíse Luminex chun dul leisisteach an céanna leagtha desmacht samplaí, eadhon 7 sraitheach 4-fillte caoluithe ar rialú dearfach SARS-CoV-2deontóir linn snámha (N = 20 deontóirí, ag tosú caolú 1/100, Forlíontach Fig. 1f) agus a réamh-paindéim sláintiúil deontóir linn snámha (caolú 1/100, N =20 deontóir, ForlíontachFíor 1f). Ceadaíonn na rialuithe dearfacha agus diúltacha seo feidhmíocht mheasúnachta a rialúncetrasna tomhais neamhspleácha agus ina theannta sin cumasúsiarghabhálachcaighdeánú i gcoinne rialuithe seachtracha más gádadh.
Sainmhíniú de SARS-CoV-2 seropositivity isteach ABCORA 2.0 agus ABCORA 5.0. Chunidirdhealú a dhéanamh idir SARS-CoV-2-antasubstaintí tras-imoibríocha, d’fhéadfaimiseficurtha MFI- Tairseacha FOE do gach ceann de na 12 teaglaim rang antaiginí SARS-CoV-2 agus Igs bunaithe ar plasma antasubstainte reghníomhaíocht isteach oiliúint cohóirt (Forlíontach Táblaí 3 agus 4). Áiríodh orthu seo deontóir sláintiúil réamhphaindéimeach lchlasma (Traenáil I, N = 573),deontóirí le le déanaí HCV ionfhabhtú (Traenáil II, N = 75; OC43 (N = 27), HKU1 (N = 17), NL63 (N = 22), 229E (N=9)) agus deontóirí a bhfuil ionfhabhtú SARS-CoV-2 deimhnithe orthu (Traenáil III, N = 175). Tairseacha bhí leagtha chun íoslaghdúdearfacha bréagachaagus ag cinntiú íogaireacht le haghaidh SARS-CoV-2bhrath antasubstainte agus chun teacht aran tsonraíocht fhoriomlán thuase99 faoin gcéadagus san áireamh leibhéil le haghaidh teorann-líne imoibríocht le haghaidh IgGRBD,IgG S1, agus IgG N chun ceadaigh freisin measartha antashubstaint imoibríocht chun iad seo antaiginí to bheith scrúdaíodh. MFI-FOE léann de aonair samplaí bhí claochlaithe isteachluachanna scoite thar chomhartha (SOC) (MFI-FOE/tairseach). SOC values bhfuil úsáidtear le haghaidhasailcanadh dearfach imoibríocht le haghaidh gach aonair antaigin-antashubstaint aicme teaglaim, le SOC > 1 a shainíonn imoibríocht dhearfach, agus SOC < 1 ag léiriú imoibríocht dhiúltach.Cathain socrú aonair tairseacha, é caithfidh bheith mheas go le haghaidh gach de an 12 tóraigh gníomhaíochtaí d’fhéadfadh tras-imoibríochtaí tarlú. Le 12 paraiméadair SOC aonair taifeadta, foriomlán spcifichathair beidh laghdú dá ar bith dearfach SOC neamhspleách suffices chun ráta a sampla tríd is tríd mar SARS-CoV-2 antashubstaint dearfach. Chun eiseamláiri:Ag glacadh leis freagraí neamhspleácha, suimeoidh fiú sainiúlacht ard 99 faoin gcéad do gach antaigin suas to sainiúlacht iomlán íseal 88 faoin gcéad ar fud na measúnachta ar fad. D'éiligh muid mar sin for SARS-CoV-2 dearfach ag glaoch isteach ABCORA 2.0 a íosta de dhá sonraficathracha chun bhaint amachghníomhaíocht os cionnantairseach. Na comhluachanna SOC a úsáidtear chun an t-iomlán a shainmhíniúsonraítear serostatus sampla tugtha i dTábla Forlíontach 5. Le haghaidh IgG RBD, S1, agus N,ar thaifeadamar gníomhaíocht SOC teorann ina leith freisin, cheadaíomar ateaglaim de 1 imoibríocht antaigin SOC > 1, an dara imoibríocht SOC > teorann. Tá an finail tairseach agus dearfach glaoch critéir ceadaithe le haghaidh difreáil de pháirteach (go luath serotiontú le amháin IgM agus IgA freagraí) chun lán ser- comhshó (incluing IgG freagraí) (Forlíontach Tábla 5). I bhreis, na critéir sonraigh samplaí a bhfuil imoibríocht lag acu agus/nó imoibríocht neamhchinntithe(Tábla Forlíontach 5).
Chun an chomparáid betw a éascúéin ABCORA 2.0 agus ABCORA 5.0 an céannatairseach baineadh úsáid as scoiteanna le haghaidh ABCORA 5.0. Roghnaíomar gan scoite sonrach a chruthútairseacha d’imoibríocht antashubstainte HCV mar an cruinn defináisiún de a diúltachtá an fhreagairt casta mar gheall ar an nochtadh forleathan do HCoVanna agus considímheasúiltras-imoibriú antasubstainteghníomh idir leo. HCV freagraí bhí ach san áireamh sa statistical anailísí mar MFI-FOE luachanna.
Sainmhíniú de SARS-CoV-2 seropositivity ag baint úsáide as loighistice aischéimniú rangú.
Classifiiarratas de seropositive in aghaidh seronegative samplaí isteach ABCORA 2. 1 tuigeadhag baint úsáide asloighistice aischéimniú. Tá an comhionann oiliúint agus bailíochtú sonraí úsáidtear le haghaidh an bunaíocht de ABCORA 2.0 bhí úsáidtear. Mar an ABCORA 2.0 imoibríochtaí ceangailteacha Bhí na hathróga seo a leanas san áireamh sa mhúnla (Forlíontach Fig. 6a): an mean luach de gach freagairt IgG MFI-FOE (RBD, S1, S2, N), an mean luach de freagairtí IgA MFI-FOE i gcoinne CA, S1, agus S2, agus an meán luach na bhfreagraí IgM MFI FOE i gcoinne CA, S1, agus S2. Freagra IgA agus IgMs go N eisiata toisc nach raibh siad cnuasaithe le freagraí eile an I céannag aicme (Forlíontach Fig. 6a). Baineadh úsáid as an aischéimniú lóistíochta chun meastachán agus tuar a dhéanamh dóchúlacht sampla tugthae chun bheith dearfach (p) mar cur síos isteach chothromóid (1).
Paraméadar 0, G, A, agus M bhí measta ar an oiliúint tacar sonraí. A sampla sainmhínithe ansin mar dheimhneach dá mbeadh an dóchúlacht tuartha go mbeidh sé dearfach thuasa tairseach c/. Sainmhíníodh an tairseach seo chun sainiúlacht de 0 ar a laghad a fháil.99 agus íogaireacht uasta ar an tacar sonraí oiliúna (ar an mbealach céanna to c le haghaidh an randamach foraoise). Iachoimre, isteach ABCORA 2. 1, sainmhínítear sampla nua ar bith mar shéardearfach más dóchúlacht é de bheith seropositive mar atá measta ag an aischéimniú lóistíochta os cionn c/. Déanann muid anailísre a dhéantar i leagan Rn 3.6.3. Sainmhíniú de SARS-CoV-2 seropositivity ag baint úsáide as randamach foraoise rangú. Aicmiú seropositive verus seronegative samplaí isteachancomhthéacs de ANCORA 2.0 agus ABCORA 5. Bhí 0 realized ag baint úsáide as a randamach foraoise chuige leanas ansocrú bunúsach randoma foraoisí mar cur síos isteach57. Tá an randamach foraoise féin bhí tógtha de ghrúpa 1000 crann aicmiúcháin ag baint úsáide as freagraí MFI-FOE (IgA, IgG,agusIgM in aghaidh CA, S1, S2,N). Tá an dóchúlacht de a sampla á dearfach mar réamh- arna dheachtú ag an bhforaois randamach ná meán an probálacha thar go léir 1000 crainn. Ar deireadh, tá sampla deficurtha mar dearfach dá a dóchúlacht de á dearfach tá os cionn a threshold c, a tá deficurtha mar chun fuair a sonrafichathair de ag laghad 0.99 agus a uasta íogaireacht ar an traeining tacar sonraí. I achoimre, ar bith nua sampla tá deficurtha marseropositive má its dóchúlacht de á seropositive mar measta le an randamachforaoise os cionn an threshold c. muid stiúradh a sraith de randamach foraoise anailísí a bhreithnigh ar fhreagraí SARS-CoV-2 amháin nó SARS-CoV-2 agus HCV freagraí isteach ABCORA 2.0 agus ABCORA 5.0: bhí ABCORA 2.2 agus ABCORA 2.3oilte agus úsáidtear le haghaidh réamhinsint ar ABCORA 2.0 sonraí agus san áireamh amháin SARS- CoV-2 freagraí nó SARS-Freagraí CoV-2 agus HKU1, faoi seach. ANCORA 5.4 (freagraí SARS-CoV-2 amháin) agus ABCORA 5.5 (SARS-CoV-2 agus HCVfreagraí) bhí oilte ar ABCORA 5.0 sonraí. Sonraí maidir le cuimsiú sonraí don faoi seach samhlacha bhfuil liostaithe isteach Forlíontach Tábla 3 agus Forlíontach Tábla 10. Rinneadh anailísí i leagan R 3.6.3 ag baint úsáide as packagtá randamachForaoise agus saoiste58–61.
Chun stóinseacht ár gcuid torthaí a chinntiú, rinneamar sensitivity anailís trí randamú na tacair sonraí oiliúna agus bailíochtaithe ag baint úsáide as tras-bhailíochtú fillte 5-modh. An dá shraithde dearfach agus claonchlónna samplaí bhí roinnte isteach five comhionannpáirteanna agus againn deficurtha go bealach five bailíochtú tacair (comhdhéanta de an i-ú leagtha dedearfacha agusan i-ú leagtha de claonchlónna, i = 1.5). Tá an scíthe de an sonraí bhí úsáidtear le haghaidhoiliúint an ABCORA 2.3 foraoise randamach. I gcás gach tacair bailíochtaithe, beidh an tsonraíocht agusíogaireacht de an randamach foraoise bhí ríomh ar an oiliúint, bailíochtú, agus oiliúintmóidebailíochtú tacair (Forlíontach Tábla 6).
Bailíochtú agus fíorú ag baint úsáide as seachtrach rialuithe. muid úsáidtear an frith-SARS- Painéal Fíoraithe CoV le haghaidh Measúnachtaí Séireolaíochta (NIBSC cód: 20/B770, NIBSC) chunfeidhmíocht na tástála ABCORA 2.0 agus ABCORA 2.3 a fhíorú. Séireamsgo leorde an verifiiarratas painéal tomhaiste le ABCORA 2.0/2.3 mar a thuairiscítear agus na torthaíi gcomparáid le torthaí na dtástálacha atá ar fáil ar bhonn tráchtála a thuairiscigh an NIBSC (32 agus Tábla Forlíontach 7). Táimid ag buileaici verifieag an íogaireacht de an ABCORA 2 scrúdú isteach bhrath SARS-CoV-2 ionfhabhtú isteach comparáid dhíreach le tráchtálatástálacha. Antaboidis stádas de plasma ó SARS-CoV-2 dearfach daoine aonair (N = 171) bhí anailísd le an leanas scrúdú córais: San áireamh scrúdú córais spriocdhírithe an N próitéin (Elecsys® frith-SARS-CoV-2 (Roche Diagnostics GmbH)), an réigiún RBD de an S próitéin (Elecsys® frith-SARS-CoV-2 S measúnacht (Roche Diagnostics GmbH)),agus an S1 fo-aonad (EUROIMMUN frith-SARS-CoV-2 ELISA (IgG)) (ForlíontachTábla 8). Rinneadh gach measúnacht dá réiran monaróir's treoracha isteach an diagnóisic aonad de an Institiúid de Leighis Víreolaíocht, Ollscoil na Zurich, Eilvéis.
SARS-CoV-2 ceangailteach antashubstaint titers. Chun define ceangailteach antashubstaint titers, ocht
sraitheach 4-fillte caoluithe ag tosú le a 1/25 caolú de plasma bhí ullmhaithe agus tomhaiste isteach ABCORA 2.0.Chun faisnéis chainníochtúil a dhíorthú, ceartaíodh luachanna MFI le haghaidh chúlra ghníomhaíocht (MFI-folamh coirnín smacht) agus againn deficurtha an cheantair faoi an MFI cuar (AUC) trasna na sraithe caolaithe do gach antaigin-Igteaglaim. Mar dhara léamh amach cainníochtúil, ríomhamar 50 faoin gcéad titer éifeachtachcomhchruinnithe (CE50) ag baint úsáide as a cuar loighisticice ceithre pharaiméadar (y=Bun móide (Top-Bottom)/(1 móide 10 ^((logEC50-X) * Fána Chnoic))).
Cainníochtú de SARS-CoV-2 S1 agus RBD ghníomhaíocht. muid úsáidtear dhá chuige chuncaighdeánaigh SARS-CoV-2 S1 agus RBD ghníomhaíocht. Tá an fichéad bunaithe ar an S1/RBD antashubstaint shonrach CR3022 (38 agus Tábla Forlíontach 13). caoluithe sraitheach de IgG, IgA, agus IgM leaganacha de CR3022úsáideadh iad chun cuair chaighdeánacha a chruthú ar RBD agus S1 cótad coirníní. Tá an líneach raon de an caighdeánach agus sampla caolú cuair bhíúsáidtear le haghaidh chainníochtaithe. muid fitted a ceathair-paraiméadar loighistice cuar (y = Bunmóide (Barr-Bun)/(1 móide10^((logEC50-X) * Fána Chnoic))) (Forlíontach Fig. 7b)
through a MFI luachanna de tomhaiste samplaí bhfuil idirshuite isteach acomhfhreagrachtiúchan deantashubstaint (µg/ml). muid úsáidtear seo chuige chun chainníochtú an tiúchan imoibríocht antasubstainte RBD agus S1 sa rialú deontóra dearfachagustoirtmheascadh úsáidte den linn deontóirí san áireamh ar gach ceann díobhABCORA pláta chun ríomh anS1 agus RBD conpuball de plasma samplaífaoi é. muid úsáidtear an céanna straitéisisteach teaglaim le an EDS Idirnáisiúnta Caighdeán frith-SARS-CoV-2 Immu-
globulin (NIBSC 20/13632) chun iarchur IU/ml ábhar de an inmheánach ABCORAdearfach deontóir linn snámha agus an aonair eiseamal thástáil (Forlíontach Fig. 7). Tá anEDS Idirnáisiúnta Caighdeán comhdhéanta de a linn snámha de plasma ó daoine aonair le hionfhabhtú SARS-CoV-2 deimhnithe. Ábhar RBD agus S1 an deontóra ABCORA dearfach linn snámha cainníochtafieag tríd an polyclonal EDS caighdeánach bhí go mór cosúil laistighgach rang Ig (Forlíontach Fig. 7b). I codarsnacht, RBD luachanna measta le anmAbCR3022 bhí a fachtóir 2.4–3.9 íochtair ná an comhfhreagrach S1 luachanna, ag moladhcaidreamh difriúilce de CR3022 le haghaidh an dhá antaiginí (Forlíontach Fíor. 7b).
Sealadach éabhlóid de SARS-CoV-2 ceangailteach antashubstaint freagra. Antashubstaint
tomhaiseadh ceangal 140 othar téarnaimhd fadaimseartha isteach274 tomhasle ABCORA 2.0, san áireamhg 251 tomhais ó 120 othair le am aitheanta ó lchositive RT-PCR. muid glacadh leis an antasubstaintí (anailís marMFI logáil isteach-FOE) bhí ag meath le am ó 21 laethanta tar éis dearfach RT-PCR agus measta an lobhadh ag baint úsáide as a cumhacht-dlí múnla measctha le héifeacht randamach ar anidircheapadh62. De réir mar a thomhaiseann an t-amath laethanta post fichéad dearfach RT-PCR toradh (Fig. 5b) nólaethanta tar éis tosú an symptómais (Forlíontach Fig. 11b) bhí fostaithe. leath-saolta (t1/2, isteach laethanta) de comharthaificant ríomhadh freagra le meath diúltach bunaithe ar an faoi seach paraiméadair meath measta. Rinneadh anailísí i leagan R 3.6.3 ag baint úsáide as pacáistí lme4 agus lmerTest63.
SARS-CoV-2 pseudo-neodrú measúnacht. SARS-CoV-2 plasma neodrú
sainíodh an ghníomhaíocht trí úsáid a bhaint as bréige bunaithe ar VEIDvíreas córas mar cur síos33. Tá anenv-díghníomhaithe VEID- 1 tuairisceoir thógáil VEID- 1NL4-3 ΔEnv-NanoLuc (VEID- 1Nanoluc) agus Ht1080/ACE2cl. Chuir P. Bieniasz 14 cill ar fáil go cineálta, Rockefeller Ollscoil, NY, Stáit Aontaithe Mheiriceá. Chun chruthú a SARS-CoV-2 spíce léiriúplasmid (P_CoV2_Wuhan), a códón-optamaithe C críochfort teasctha (AA 1255- 1273) spike ionchódú géine de strain Wuhan-Hu- 1 (Banc Gen aontachas níl. MN908947) wmar sintéisithe (Ginealas, teirmeafosfáití Iascaire Eolaiochtafic, Waltham, MA) agus clónáilte isteach pcDNA.3. 1. Spíc pseudtyped SARS-CoV-2 a chuireann víris in iúlbhí genscriosta le comh-ag aistriú 293-T cealla le a meascán de VEID- 1Nanoluc, P{0}CoV2_Wuhan, agus PEI Max (Polysciences Európ GmbH, Hirschberg, Gearmánaigh). Tar éis 48 h víreas, supernatants scagtha (0.2 µm) agus stóráilte i slánchuid ag −80 céim go dtí go n-úsáidfear é. Ionfhabhtaíocht virlinn stoic mar tomhaiste le ionfhabhtú de Ht1080/ ACE2cl. 14 cealla. Chun an 384-tobar seo plátaí cultúir pretreith le polai-L-Lisín bhí síolraithe le Ht1080/ACE2cl. 14 (2200 cill/tobar) lá amháin roimh an measúnú. Ceallabhí ionfhabhtaithe le toirtmheasctha víreas stoic agus NanoLuc luciferase ghníomhaíocht isteach cilllísáitbhítomhaiste 48 h iar-ionfhabhtú ag baint úsáide as an gCóras Measúnaithe Nano-Glo Luciferase (Promega, Fitchburg, WI). Chun seo, nite cealla uair amháin wiú PBS, ansuthach
bhí bhainteag agus cealla bhí lysed le 20 µl/go maith de Luciferase cill Lisis imoibrí
(Promega, Fitchburg, WI) le haghaidh 15 nóim faoi leanúnach ag crith ag seomrateocht. 20 µl de 1/50 maolán caolaithe NanoGlo wer curtha leis agus NanoLuc luciferaseghníomhaíocht (gaolta éadrom aonaid, RLU) bhí tomhaiste tar éis 5 nóim goir ag teocht an tseomra ar a Perkin Elmer Léitheoir EnVision. Ionchur SARS-CoV-2 pseudo-víris le haghaidh neodrún measúnachtaí bhí coigeartaithe chun toradh víreas ionfhabhtaíochtcomhfhreagrachgo 5– 10 × 106 RLU (a fhreagraíonn do 100-250-chúlra fillteundluachanna RLU) in éagmais coscairí. Gníomhaíocht neodrúcháin plasma a thomhasy sé caolú sraitheach 4-huaire de thosú plasmag ag a 1/25 caolú bhí ullmhaithe. 20 µl de an caolaithe plasma agus 20 µl deanvíreas bhí preincubated ar feadh 1 h ag 37 céim agus ansin Bhí 30 µl den mheascán víreas/plasma trfhreagair chun 384-go maith plátaí síolraithe leHt1080/ACE2cl. 14 chill i dtoirt 30 µl. Bhí tiúchan deiridh mar thoradh air seo den plasma ag tosú dilúsáid de 1/100. Plasma neodrú titers cúis50 faoin gcéad , 80 faoin gcéad ,agus90 faoin gcéadlaghdú isteach víreasach ionfhabhtaíocht (NT50, NT80, agus NT90,faoi seach) i gcomparáid chun rialuithe sin plasma bhí ríomh le fiting dáileog-fhreagairt sigmoid cuar (athróg fána) chuig sonraí an RLU, ag baint úsáide as GraphPad Prism lesrianta (bun = 0, barr = 100). Dá50 faoin gcéadchosc bhí ní bainte amach ag anis ísle lchlasma caolú de 1/100, a 'níos lú ná' luach bhí thaifeadta. Gach tomhais Rinneadh i ndúblachtes.
Ag tuar neodrú bunaithe ar ABCORA ceangailteach ghníomhaíocht. Chun comparáid a dhéanamh an
cumas de SARS-CoV-2 ceangailteach ghníomhaíocht tomhaiste isteach ABCORA 2.0 chun tuar an neodrú stádas, againn tomhaiste neodrú ghníomhaíocht chun Wuhan-Hu- 1 isteachSARS-CoV-2 dearfach daoine aonair (N = 467) agus rangfieag daoine aonair mar ardneodraitheoirí (NT50 > 250,N = 332) agus íseal neodraitheoirí (NT50 < 250,N = 135). Six difriúil rangfiiarratas samhlacha bhí deartha chun sannadh daoine aonair chun an ard nó catagóir neodraitheoirí íseal, bunaithe ar a bpatrúin cheangailteach ABCORA2.0 we seasann-
lished dhá aonathraitheach loighistice aischéimniú (ULR) samhlacha go meán MFI-
FOE spíce imoibríochtachtaí antigen S1 agus meánsroichteacht spíc antaigin RBD MFI-FOE- divities, faoi seach. Roghnaíodh S1 agus RBD mar gheall orthur airde comhghaol leNT50 (r = 0.82 agus r = 0.80 le haghaidh an Iomlán spíce imoibrithe de S1 agus RBDfaoi seach, Forlíontach Fig. 9). I bhreis chunan dá ULR seo, bhunaíomar a samhail aischéimniúcháin loighisticice ilathraithe lena n-áirítear an dá mheán S1agus RBD imoibrithe (MFI). We Tuilleadh Seiftithe trí samhlacha go mheas go léir 12 SARS-CoV-2 param ceangailteachéiri thaifeadta le ABCORA 2.0. Beirt ilathraitheach loighisticeaischéimniúbhí samhlacha bunaithe ar phríomh-chomhpháirt analsis de go léir ceangailteach gníomhaíochtaíagus san áireamh an fichéad dhá (faoi seach ceathair) príomhoide comhpháirteanna, amhínigh60 faoin gcéad (faoi seach75 faoin gcéad) den éagsúlacht sna sonraí. Chuimsigh muid freisin i Déanann ár samhail comparáid idir aicmiú bunaithe ar randamach foscíthe anailís a corpraíodh go léir 12 SARS-Athróga gníomhaíochta ceangailteacha CoV-2.
I gcás gach ceann de na sé mhúnla, rinneadh measúnú ar fheidhmíocht i 100 tacar tras-bhailíochtaithe:gach sraith bhí tógtha trí shampláil randamach gan athsholáthar i measc na 467tomhais ar fáil. 8Úsáideadh 0 faoin gcéad den tacar sonraí chun an tsamhail a oiliúint (N=374).Réamhinsint de stádas neodraithe réadaithe ar an 20 faoin gcéad eile (N=93) aguscomparáid a dhéanamhd chun an fíor NT50 luach agus neodrú stádas, ag baint úsáide as a roc cuar. Tá ancheantar faoi an cuar (AUC) bhí a ríomh do na sé mhúnla i ngach tras-bhailíochtú rith. Tá an Bayesian eolas critéar (BIC) bhí ríomh le haghaidh go léir fiveaischéimnithí lóistíochta i ngach tras-bhailíochtúian rith.
Chun méadú an fóntais de an ULR-S1 réamhinsint Mionsamhail le haghaidh cliniciúil diagnóisiccheapamara modifieag neodrú réamhinsint Mionsamhail ULR-S1-SOC bunaithe ar ancomhartha thar luach scoite (SOC).s tuairiscithe le haghaidh ABCORA 2.0. Tá an ULR-S1-SOCmeastacháin an dóchúlacht de NT50 >250 bunaithe ar shuim luachanna S1 SOC le haghaidhIgG, IgA, agus IgM mar in iúl isteach Eq. (2).
expða móide b * log 10ðsumS1SOCÞÞ PðNT50>250Þ =
Éirimh measta luachanna: a = −2.6447 agus b = 3.5353.
Rinneadh anailís ar mheastacháin ULR-S1-SOC don dóchúlacht NT50 > 100eag isteachanalaí (Supiomlánach Tábla 9 agus Forlíontach Fig. 10).
Comhlachas idir HCoVanna agus SARS-CoV-2 imoibrithe. Chun iniúchadh an
comhlachas idir HCoVanna agus imoibríocht SARS-CoV-2, shainmhíomar new Freagra HCoV athróg (HCV ard/íseal) do gach aicme antashubstainte (IgG, IgA, IgM) mar a leanas: a othar bhí ard HCV Ig imoibríocht le haghaidh a tugtha antashubstaint aicme dá atomhais bhí níos airde ná an airmheán daonra i dtrí cinn ar a laghad as na ceithre thomhas HCoV (HKU1, OC43,NL63, 229E). Chun measúnúidirspleáchais idir HCoV agus freagraí SARS-CoV-2, chuireamar na freagraí san áireamh ansin HCV freagra athróg isteach a líneach aischéimniú Mionsamhail de SARS-CoV-2imoibrithe i an rang antasubstainte céanna. Rinneadh na samhlacha aischéimniúcháin líneach a mheas ar fhochuideachtaet deSARS-CoV-2 othar dhearfach (N=204), tomhaiste ar ABCORA 5.0 níos lú ná 60 lá ó dearfach RT-PCR. Roghnaíodh an srianadh go 60 láchun samhaltú a cheadúdean éifeacht de am le splines. seotréimhse srian Tuilleadhráthaithe cothromaíocht inscne, mar a bhí deontóirí téarnaimh le leanúint suas níos faide males earcaithe le haghaidh a plasma teiripe staidéar (CPT-ZHP, Swissmedic 2020TpP1004). aischéimniúian anailísí bhí coigeartaithe ar am (laethanta post dearfach RT-PCR nó tosaigh de comharthaí; mar a splíne le 3 céimeanna de saoirse),aois (mar spline le 3 céim de saoirse), agus inscne.
I measc na 204 othar analyzed le haghaidh idirspleáchais, eolas maidir leospidéal stádas (ní san ospidéal, san ospidéal ní isteach ICU, san ospidéal san ICU) bhí eol do 160 acu. I gcás 80 othar bhí samplaí againn a bhíbailíodh níos lú ná 30 lá ó diagnóis SARS-CoV-2 trí RT- dearfachPCRmeastachán ar HCV a cheadú leibhéil dhúnadh chun SARS-CoV-2 éadáil. Rinneamar an breise anailís ar seo fothacar de othair ag baint úsáide as ordamhailaischéimniú agus cúlchéimniú loighisticeian chun tuar an ospidéal stádas ag brath ar ard nó íseal IgG HCoV imoibríocht, coigeartaithe ar aois (mar a splíne le 3 céimeanna de saoirse) agus inscne. Sheiceáil muid fnóanstóinseacht de an toradh isteach a íogaireachtanailís trí choigeartú in am ó positive RT-PCR isteach bhreis chun aois agus inscne (Forlíontach Fig. 15).
Staidrimh anailís. Rinneadh anailís staitistiúil in R (Leagan 3.6.3).
Figiúirí bhí déanta ag baint úsáide as an ggplot2 pacáiste64. Nuair a chuirtear san áireamh iad, is ionann boxplots an folísliú: airmheánach le an lár líne, Uachtarach agus íochtair ceathairíleanna le an teorainneacha bosca, 1.5x idircheathaireach raonta le an guairí, agus asluiteacha le pointí. Teas- léarscáileanna bhí déanta ag baint úsáide as an Mapa Teas Coimpléasc pacáiste65.Tábhacht Spearman céim correlachain bhí mheas tríd asymptotic t comhfhogasú. Difríochtaí isteach means idir dhá grúpaí le neamhspleách bearta bhí thástáil ag baint úsáide as dhá-taobh t-tástálacha. Nuair is infheidhme, miolra tástáil bhí coigeartaithe ag baint úsáide as Bonferroni ceartúchán le haghaidh comparáidí iolracha. A are-bealach ANOVA le 3 céimeanna de saoirse bhí úsáidtear isteach bhreis chun dhá-eireaball t-tástálacha i bhFíor.6 chun léargais a sholáthar ar an iomlán in aghaidh an ghrúpa comparáid. Nuair a dhéantar anailís ar thacair sonraí áirítearng arís agus arís eile tomhais de andaoine céanna (Fig.3a, Fig.5b, Fig.5c, Supiomlánach Fig. 8a, Forlíontach Fig. 11b), d'úsáideamar samhlacha measctha líneacha agus cumhachta-dlí le himeacht ama ó dearfach RT-PCR nó am ó shin symptom tosaigh (leanúnach nó dhénártha athróg) mar fiéifeacht xedagus aonair mar a randamach éifeacht. I an cás de Fig.5c agus Fíor Forlíontach 11c, Measadh na míbhuntáistí a bhain le fána laghdaitheach na leibhéal neodraitheidering daoine aonair amháin le neodrú titers os cionn an bhrath leibhéil (NT50 >100) aga gcéad tomhas. I gcás gach múnla measctha líneach, tá thart ar Satterthwaiteationtúle haghaidh úsáideadh t-tástáil dhá thaobh chun a fháil amach an raibh an fhána measta suntasachy difriúil le 0. Ina theannta sin, fuarthas leathré from an lobhadh ráta measta ar an logáil de cheachtar acu MFI-FOE (Fíor.5b, Fíor Forlíontach 11b) nó NT50s (Fíor.5c,Forlíontach Fig.11c) mar a leanas: t1/2=t0 * exp(log10(2)/rate), le
t0=21 lá ó positive RT-PCR nó ó shin symptom tosaigh. I Fig. 7b, c, líneachaischéimnithí bhí úsáidtear chun meastachán an Comhlachas idir HCV agus SARS-CoV-2 imoibríochts: a Dalta t-scrúdú le a dhá-taobh hipitéis bhí úsáidtear chun measúnú dá seoComhlachas bhí comharthaificantalach difriúil le 0.
Tuairisciú achoimre. Tuilleadh eolas ar taighde dearadh tá ar fáil isteach an Dúlra
Reseáirse Tuairisciú Achoimre nasctha chun seo alt.






