Suaitheadh ​​Víróim Urinary in Trasphlandú Duán

Teagmháil: Audrey Hu Whatsapp/hp: 0086 13880143964 Ríomhphost:audrey.hu@wecistanche.com

Tara K. Sigdel et al

Tá an micribhithóim daonna tábhachtach don tsláinte agus tá ról aige i bhfeidhmeanna meitibileach riachtanacha agus cosaint ó phataiginí áirithe. Os a choinne sin, feictear dysbiosis an mhicribhithóim i gcomhthéacs galair éagsúla. Tá sé léirithe ag staidéir le déanaí go ndéanann pobal miocróbach casta ina bhfuil na céadta baictéar coilíniú ar an gconair shláintiúil urinary, ach is beag atá ar eolas faoi na víris urinary daonna i sláinte agus galair. Measúnú a dhéanamh ar víreas urinary daonna i gcomhthéacs naduántrasphlandú (tx), rinneadh measúnú ar éagsúlachtaí i gcomhdhéanamh na víróim fuail i samplaí fuail ó ghnáthoibrithe deonacha sláintiúla chomh maith le hothair leduángalartar éis dóibh dul faoi duáin tx. Rinneadh anailís crómatagrafaíocht leachta-speictriméadracht maise/mhais-speictriméadrachta ar chohórt roghnaithe de 142duáintx agus gnáthrialuithe sláintiúla, ó bhithbhainc níos mó de 770duánsamplaí fuail meaitseáilte bithóipse. Chomh maith le hanailís ar fhual rialaithe gnáth sláintiúil, an cohórt deduánBhí aicmiú feinitíopa dearbhaithe bithóipse ag othair tx, comhtharlú leis an sampla fuail a ndearnadh anailís air, de ghreannáin chobhsaí (STA), diúltú géara, neifritis víreas BK, agus neifropathy allagrafta ainsealach. D’aithníomar 37 víreas uathúla, 29 acu á n-aithint don chéad uair i samplaí fuail daonna. Tá difríocht idir comhdhéanamh víróim fuail an duine ó thaobh sláinte agus gortú duáin, agus d’fhéadfadh tionchar breise a bheith ag nochtadh próitéiní víreasacha sa chonair urinary ag nochtadh IS, aiste bia, agus nochtadh comhshaoil, aiste bia, nó cutaneous d’fheithidicídí agus lotnaidicídí éagsúla.

Eochairfhocail: duántrasphlandú, virome, fual, próitéamaíocht, bithmharcóirí

Coscann Cistanche tubulosa galar duáin, cliceáil anseo chun an sampla a fháil

RÉAMHRÁ

Tá staidéar déanta go forleathan ar an micribhithóim daonna i mbithshreabháin éagsúla, mar shampla fuil (1), fual (2-4), seile (5, 6), sreabhán cerebrospinal (7), agus lavage bronchoalveolar (8, 9), as a thionchar. ar shláinte an duine agus ar ghalair (10). Tuairiscíodh go leor tuarascálacha ar mheasúnú micribhithóim i réigiúin éagsúla den chorp daonna lena n-áirítear an scamhóg agus an putóg (11-15). Mar sin féin, níl ach beagán ar eolas faoin micribhithóim fuail agus a athruithe i gcomhthéacs díobhála duáin tar éis trasphlandú duáin (tx) (16, 17). Tá an chuid is mó de staidéir mhicribhithóim daonna tar éis 16S rRNA a mhapáil le haghaidh próifíliú baictéarach (18), agus níl ach comhlacht beag sonraí a scrúdaíonn an víreas fual (19, 20), agus tá staidéar foilsithe amháin tar éis úsáid a bhaint as seicheamhú den chéad ghlúin eile chun comhpháirteanna géanómacha víreasacha a mhapáil. i bhfual na n-othar trasphlandúcháin duáin (19).

Tá baint ag dysbiosis an mhicribhithóim le galair iolracha ar nós galar putóige athlastach, ailse drólainne, otracht, agus galar scamhógach (21-25), ach is beag atá ar eolas faoi athruithe ar an víróim i sreabhán coirp daonna, mar seile, lavage bronchoalveolar, agus fual. Aithnítear go gcomhlíonann comhpháirteanna éagsúla den mhicribhithóim feidhmeanna riachtanacha lena n-áirítear bithsintéis comhfhachtóirí agus vitimíní, meitibileacht na gcomhdhúile riachtanacha, agus cosaint bhacainn ó phataiginí (26-28). Féadfar feidhmeanna dysbiotic agus cosanta den chineál céanna a chur i leith víreas na fual freisin; mar sin, tá sé tábhachtach comhdhéanamh an víreas daonna i sláinte agus galair a fháil amach. Chun críocha an staidéir seo, roghnaigh muid na staidéir seo a dhéanamh i bhfual i sláinte agus i gcomhthéacs nochtadh IS tar éis duáin tx, le linn feidhm duáin chobhsaí, agus i gcomhthéacs díobhála tx duáin. Ba é fócas an staidéir ná stór víreas a mheas mar a chinn na peptídí atá i láthair i bhfual an duine agus a n-imní tar éis nochtadh IS agus cúiseanna éagsúla le gortú duáin ghéarmhíochaine, ainsealacha agus ionfhabhtaíoch.

Athraíonn an microbiome le himeacht ama agus comhghaolann sé le héagsúlacht orgánach. Is féidir anailís Micribhithóim a dheighilt ina anailís struchtúrach araon bunaithe ar aonaid tacsanomaíoch oibriúcháin atá bunaithe ar phylogeny seicheamh, agus anailís fheidhmiúil bunaithe ar sheicheamhú meitigenomics agus próitéamaíocht (29, 30). Is féidir tuilleadh staidéir a dhéanamh ar mhicribhiota aitheanta i ngalar éagsúla trí shaothrú, meitigenomics feidhme, agus imdhíonfluaraiseacht ilphléacsach agus hibridiú in situ. D'fhoilsigh tionscadal micribhithóim daonna NIH an micribhithóim daonna i 15 shuíomh coirp ó 300 duine aonair (31).

CÓIREÁIL GALAIR DUAN: CISTANCHE

ABHAIR AGUS MODHANNA

Rinneadh measúnú ar 142 sampla uathúla san iomlán ó bhiththaisce ina raibh 2016 bailithe ag an IRB toiliú feasach ó shamplaí fásta agus péidiatraiceacha ó na cláir tx duáin ag Ollscoil Stanford agus Ollscoil California San Francisco, idir samplaí fuail a raibh duán comhoiriúnaithe ag gabháil le 770 acu. Léann tx box le histeolaíocht paiteolaíochta láraithe agus scóir urrann ag baint úsáide as scéimre caighdeánaithe Banff (32) chun duáin tx a scóráil trí ghortú (Fíor 1). D’fhaomh an Clár um Chosaint Taighde Daonna de chuid Ollscoil California, San Francisco an staidéar. Rinneadh na samplaí fuail a fheinitíopáil bunaithe ar phaiteolaíocht bx duánach comhoiriúnaithe i gcúig ghrúpa: rialú sláintiúil (HC; n=9), graft cobhsaí (STA; n=40), diúltú géarmhíochaine (AR; n {{). 7}}), nephropathy allograft ainsealach (CAN; n=39), agus nephritis víreas BK (BKVN; n=17). Lártheifníodh fual 2,000 ×g ag 4 chéim ar feadh 20 nóiméad chun fáil réidh le dríodar fuail. Cuireadh an súiteán trí scag-scannán 10 kDa chun peiptídí dúchasacha a bhaint as próitéiní slána atá níos mó ná 10 kDa i méid. Ansin díleádh trypsin an phróitéin iomlán agus rinne an t-ardán LC-MS (Orbitrap Velos MS) anailís ar na peiptídí tripteacha a d’eascair. Tuairiscítear na modhanna mionsonraithe maidir le hullmhú agus anailísí próitéine in áit eile (33).

Baineadh úsáid as an MSGF móide algartam saincheaptha arna ghiniúint ag ár ngrúpa (https://omics.pnl.gov/software/ms-gf), chun speictream MS/MS a chuardach i gcoinne bhunachar sonraí comhcheangailte próitéine daonna agus bunachar sonraí víreasach an NCBI. Sainaithníodh peptides ar dtús ó chuardach bunachair sonraí agus na critéir seo a leanas á gcur i bhfeidhm: speictream MSGF E-luach (luach dóchúlachta an pheptíde le speictream MS/MS mheaitseáil leis an luach níos ísle an dóchúlacht níos airde a bheith ina mheaitseáil cheart) a bheith<10-10, peptide="" level="" q-value="" (false="" discovery="" rate="" estimated="" by="" targeted-decoy="" database="" search)="" to="" be=""><0.01, and="" mass="" measurement="" error=""><10 ppm="" (±5="" ppm).="" the="" decoy="" database="" searching="" methodology="" was="" used="" to="" confirm="" the="" final="" false="" discovery="" rate="" at="" the="" unique="" peptide="" level="" to="" be=""><1%. due="" to="" the="" anticipated="" higher="" false="" discovery="" rate="" for="" peptides="" from="" viral="" proteins,="" more="" stringent="" filtering="" criteria="" with="" msgf="" spectrum="" e="" value="" to="" be=""><1e-13 was="" applied.="" the="" false="" discovery="" rate="" was="" estimated="" to="" be="" nearly="" 0%="" based="" on="" the="" well-accepted="" target="" decoy="" searching="" strategy="" because="" no="" decoy="" hits="" were="" observed="" following="" this="" stringent="" cutoff.="" data="" are="" shown="" as="" percentages="" and="" mean="" ±="" sd.="" comparisons="" of="" different="" categories="" are="" done="" using="" anova="" and="" p="" values="" of=""><0.05 are="" considered="">

TORTHAÍ

D'fhoilsigh ár ngrúpa roimhe seo anailís mhionsonraithe ar phróitéiní daonna atá ábhartha go bitheolaíoch sna samplaí fuail seo a bailíodh ó fhaighteoirí trasphlandúcháin duáin le feinitíopaí díobhálacha graft éagsúla, mar a dheimhnigh histeapaiteolaíocht trasphlandúcháin duán comhoiriúnaithe ar an bithóipse, a bailíodh ag an am céanna leis an sampla fuail; tá na sonraí seo i dtaisce sa stór próitéamaíoch MassIVE (aontachas MSV000079262) agus i stór ProteomeXchange (aontachas PXD002761) (33). Sa staidéar seo, níor dhírigh muid ach ar phróitéiní víreasacha a aithint agus a anailísiú sa chohórt céanna d’othair trasphlandúcháin duán, agus cuimsíodh freisin samplaí fuail daonna um rialú sláintiúil de réir aoise agus inscne chun próitéiní víreasacha a mheas maidir le sláinte agus díobháil duáin. . Tá sé tábhachtach a thabhairt faoi deara, as na próitéiní daonna agus víreasacha iomlána anailísithe i bhfual, gurb ionann próitéiní víreasacha amháin<0.2% of="" the="" total="" identified="" proteins,="" highlighting="" the="" very="" low="" abundance="" of="" rather="" rare="" viral="" proteins="" in="" human="" urine,="" irrespective="" of="" the="" type="" of="" kidney="" injury,="" and="" irrespective="" of="" baseline="" immunosuppression="">

Tagann na torthaí a chuirtear i láthair sa pháipéar seo ó mhapáil peptide víreasach, murab ionann agus seicheamhú genomic de chomhpháirteanna víreasacha mar a thuairiscigh foilseacháin roimhe seo (19). Mar anailís tosaigh, dírímid ar leitheadúlacht próitéiní víreasacha urinary a bhaineann go sonrach le gach feinitíopa trasphlandúcháin duáin de STA, AR, CAN, agus BKVN, agus na héagsúlachtaí a tugadh faoi deara thar an virome fual rialaithe sláintiúil. Rinneadh measúnú ar shonraí próitéine víreasacha urinary do gach sampla maidir le flúirse samplaí i gcoibhneas le meánleibhéal an víris sin sa daonra samplála ar fad. Fuaireamar amach, ar an meán, go raibh próitéiní víreasacha éagsúla braite ina bhfual ag 22 faoin gcéad (raon 4-67 faoin gcéad) d’othair trasphlandúcháin duán, gan othair le BKVN a áireamh, áit a bhfuiltear ag súil le bhrath an víreas BK i bhfual, mar na hothair seo. ionfhabhtú le víreas BK a bheith acu ina gconair urinary agus sa trasphlandú duán. Léirítear dáileadh próitéiní víreasacha éagsúla i stáit díobhála tx éagsúla agus gnáthshláinte sa léarscáil teasa leitheadúlachta (Fíor 2). Ar an iomlán, aithníodh 57 próitéin víreasach san iomlán as 37 víreas uathúla, go leor díobh seo gan choinne agus nár tugadh tuairisc orthu roimhe seo mar "comhmheasanna" i bhfual daonna. As na víris uathúla seo, ba víris RNA aonshnáithe iad 8 víreas, víreas RNA-RT aon-shnáithe a bhí i víreas amháin, agus ba víris DNA dhá shnáithe iad 28 víreas (Tábla 1). As na 142 othar, bhí próitéin víreasach amháin ar a laghad ina bhfual ag gach othar, le meán de 10.23 ± 4.57 próitéin víreasach/sampla.

Leitheadúlacht Próitéiní Víreasacha Fual Daonna

Bhí 20 próitéin víreasach uathúla ag an ngrúpa rialaithe sláintiúil a scrúdaíodh le meán grúpa de 13.67 ± 1.32 próitéiní víreasach. Bhí líon na víreas uathúla sa ghrúpa i bhfad níos ísle go staitistiúil ag othair duán tx le IS cothabhála agus feidhm tx duánach cobhsaí (8.08 ± 2.78; p=7e-10) i gcomparáid leis an gcohórt sláintiúil (duáin gnáth fheidhm agus gnáthchóras imdhíonachta), gan aon nochtadh IS. Aithnítear naoi bpróitéin víreasacha nua sa chohórt STA ina ionad sin i gcomparáid le rialuithe sláintiúla, a bhaineann leis na víris seo a leanas: víreas Junin, Cotesia congregata bracovirus, Agrotis segetum nucleopolyhedrovirus, Psittacid herpesvirus 1, víreas Pseudocowpow, Spodoptera frugiperda nucleopolyhedroviruses, víreas Seapáinis agus il-núicléasra, víreas na Seapáine. Víreas mottle Cowpea, agus nucleopolyhedrovirus aonair Helicoverpa zea. Mar thoradh ar ghortú duáin tar éis tx (in ainneoin nochtadh leanúnach IS), tá méadú foriomlán ar líon na próitéiní víreasacha uathúla thar an chohórt STA tx, le méadú suntasach ar phróitéiní víreasacha fual i ngrúpa othar CAN (11.46 ± 3.52; p {{ 16}}e-10), agus an grúpa othar BKVN (15.76 ± 5.65; p=13.7e-10). Is cosúil go bhfuil stór próitéiní víreasacha fuail an-difriúil i gcatagóirí díobhálacha tx éagsúla (Fíor 3). Méadaíonn leitheadúlacht próitéiní víreasacha BKV i bhfual go 60-70 faoin gcéad in AR, 70-80 faoin gcéad in othair i CAN, agus 100 faoin gcéad in othair le BKVN (Fíor 2) ag léiriú go bhféadfadh méadú ar fhlúirse víreas BK san fhual a bheith mar thoradh. ó mhéadú IS, mar a fheictear sa chatagóir AR, agus le níos mó ama i ndiaidh tx, mar a fheictear sa chatagóir CAN. Léiríonn samplaí fuail BKVN an éagsúlacht uasta de phróitéiní víreasacha urinary, mar a bhíothas ag súil leis. Ní thugtar faoi deara a thuilleadh sa chohórt BKVN ceithre phróitéin víreasach atá i láthair go comhsheasmhach i ngach sampla eile, lena n-áirítear gnáthrialuithe sláintiúla (víreas Canarypox, víreas Tacaribe, víreas Simian 12, víreas Acidianus filamentous 8). Toisc gur víreas DNA é BKV, rinneamar scrúdú an bhfuil baint den chuid is mó ag na hathruithe ar an víreas fuail le teacht chun cinn víris DNA nua i BKVN. Tugtar faoi deara cúig phróitéin víreasach nua ach amháin sa chohórt BKVN (Ectropis obliqua nucleopolyhedrovirus, Fowl adenovirus D, víreas siondróm Taura, víreas iridescent inveirteabrach 6, herpesvirus Gallid 2). Bhí 4/5 de víris chohórt BKVN ina víris DNA dhá shnáithe (Tábla 1).

An raidhse Próitéiní Víreasacha Fual Daonna

An chéad uair eile rinneamar measúnú ar an raidhse de phróitéiní víreasacha éagsúla thar gach othar tx agus samplaí fuail HC. I measc na 37 víreas uathúla a scrúdaíodh, ba iad na víris seo a leanas na cinn is flúirseach in othair STA IS (Víreas Acidianus filamentous 8, nucleopolyhedrovirus Agrotis segetum, polyomavirus BK, víreas Canarypox, bracovirus Cotesia congregata, víreas mottle Cowpea, faireog salivary pallidipes Glossina, Tá víreas Simian 12, víreas Tacaribe), agus raidhse méadaithe den Marsellavirus le feiceáil in CAN agus BKVN araon. In ainneoin ionfhabhtú infhéitheach leis an víreas BKV in othair BKVN, tugaimid faoi deara go n-aimsítear leibhéil ísle den víreas BK freisin i ngach catagóir tx scrúdaithe agus rialuithe sláintiúla, is dócha gurb é an víreas BK ná gnáth-choimeád fual an duine, agus a sheasmhacht san uroepithelium daonna. ag leibhéil ísle i mbeagnach gach othar HC agus tx duáin gan choinne.

CÓIREÁIL GALAIR DUAN: CISTANCHE

PLÉ

Cuirtear san áireamh i staidéar ar ról an mhicribhithóim i dtrasphlandú orgáin (13, 17, 34) an tionchar a bhíonn ag iontógáil bia, díleá, meitibileacht agus modhnú; áfach, tá dysbiosis an mhiocróib mar gheall ar na cógais tx agus IS ina fhachtóir a chuireann laghdú ar na miocróib ceannasacha bunlíne agus go gcailltear éagsúlacht fhoriomlán, agus teacht chun cinn roinnt daonraí miocrób ceannasach nua (35). Toradh an-suimiúil ón staidéar seo is ea nach ndearnadh cur síos ar dhaoine roimhe seo ach ar 8 gcinn as na 37 víreas a aithníodh sa tacar sonraí seo, agus go ndearnadh cur síos ar go leor díobh seo a bheith pataigineach freisin. Tá cur síos déanta ar ionfhabhtuithe daonna le roinnt de na víris a aithníodh, rud a thugann le tuiscint go bhféadfadh baint a bheith ag a láithreacht sa fhual le pataigineas de ghortú sistéamach ginearálta nó de bhunghortú duánach. Is féidir le hionfhabhtú víreas Junin (réanaivíris) a bheith mar thoradh ar ghalar daonna cliniciúil lena n-áirítear fiabhras, chomh maith le haonán ar a dtugtar fiabhras hemorrhagic na hAirgintíne (36). Is réimse víreas é víreas Tacaribe a d'fhéadfadh fiabhras daonna agus galar hemorrhagic (36) a chur faoi deara freisin. Is víreas an-choitianta é an víreas HHV i leanaí agus is cúis le fiabhras, buinneach agus gríos (37). Is víris RNA aon-shnáithe iad rhinoviruses arb iad an gníomhaire tógálach is mó i ndaoine agus an culprit is dóichí don slaghdán (38). Tá víreas clorella dromchla Acanthocystis 1 i 44 faoin gcéad de dhaoine sláintiúla (39) agus níor cuireadh síos air ach san oropharynx agus ní fios go bhfuil sé pataigineach do dhaoine. Is víreas DNA mór nucleocytoplasmic é an víreas Marseille a bhfuil cur síos déanta air san fhuil agus i stól othair le lymphadenopathy nonfebrile (40).

Polyomavirus DNA is ea an víreas SV40 a tugadh isteach sa daonra daonna trí vacsaíní éillithe (41) agus is minic a dhéantar ionfhabhtú leis an víreas seo a chomh-ionfhabhtú le hionfhabhtú víreas BK, agus is toradh beagnach athróg é seo sa daonra tx. Tá béim curtha ag staidéir le déanaí freisin ar an ról atá ag ionfhabhtú ainsealach SV40 le hailse daonna (42). Tras-imoibríonn antasubstaintí i gcoinne antaigin T de SV40 le hantaiginí T víris BK agus JC, atá ar fad sa teaghlach polyomavirus, agus úsáidtear an stain SV40 chun ionfhabhtú víreas BK a dhiagnóisiú i BKVN. Tá nochtadh víreas BK, sna duáin, le feiceáil i 90 faoin gcéad den ghnáthdhaonra, agus tugann ár sonraí le fios go bhfuil rianta de phróitéiní víreasacha BK ag an víreas fuail sna rialuithe sláintiúla go léir a sampláil.

Feictear macasamhlú víreas BK i 10-60 faoin gcéad de na hothair duáin tx ar cuireadh síos orthu an víreas BK a chaillfidh ina bhfual, rud atá deimhnithe ag ár sonraí (Fíor 2). Tá víreas BK folaigh i gcealla epithelial tubular duánach agus is eol go n-ardóidh a leitheadúlacht mífheidhmiú imdhíonachta agus nochtadh imdhíonachta (43). Sa staidéar seo, níorbh fhéidir linn aon difríochtaí a bhaineann go sonrach le virome fuail a aithint a d'fhéadfadh idirdhealú a dhéanamh idir na grúpaí AR agus BKVN, in ainneoin go bhfuil na coinníollacha seo éagsúil ó thaobh imdhíoneolaíochta de agus go dteastaíonn cineálacha cur chuige cóireála an-difriúla, ie, íoslaghdú imdhíonachta i BKVN agus imdhíonacht méadaithe in AR. Deimhníodh an catagóir AR agus bhí smál diúltach SV40 sa bhosca a scrúdaíodh. Mar sin féin, tugann na sonraí seo le tuiscint go bhféadfadh sé nach dtugtar dóthain tuairisce ar bhrath BKVN in othair tx duáin, agus go bhféadfadh athruithe histeolaíocha a bheith fánach as a dtagann tearc-dhiagnóis an ghalair BKVN.

As na 19 víreas eile nár cuireadh síos orthu roimhe seo i ndaoine, tugadh faoi deara iad seo a leanas a úsáid mar lotnaidicídí/feithidicídí (E. obliqua nucleopolyhedrovirus, Euproctis pseudoconspersa nucleopolyhedrovirus, Helicoverpa armigera nucleopolyhedrovirus, H. zea aonair nucleopolyhedrovirus). Tá sé mar aidhm ag lotnaidicídí in úsáid sláinte poiblí teorainn a chur le poitéinseal an ghalair ach tá a fhios go n-imíonn siad isteach i bhfíocháin an duine/sreabháin choirp mura láimhseáiltear iad i gceart agus go gcuireann aistí bia orgánacha teorainn le líon na lotnaidicídí i bhfual leanaí (44, 45) . Ardaíonn fionnachtain na bpróitéiní víreasacha seo i samplaí fuail daonna ceist faoi nochtadh comhshaoil ​​do na hábhair salaithe féideartha seo nár aimsíodh roimhe seo.

Tugann an toradh ar leitheadúlacht 100 faoin gcéad de roinnt víreas amháin sa ghrúpa rialaithe sláintiúil le fios go bhfuil tomhais víreasacha ann a d’fhéadfadh a bheith ann gan dochar nó go bhféadfaí hipitéis a thabhairt dóibh chun cuidiú le hoiriúnú imdhíonachta. D'fhéadfadh anailís crann phylogenetic ar na víris seo a bheith suimiúil, toisc go bhfuil ról tábhachtach ag roinnt víris cosúil le baictéarophages i sláinte trí baictéir phataigineacha a bhaint agus cuidiú le díolúine dúchasach a threisiú (16). D’fhéadfadh méadú ar iomadú baictéarach a bheith mar thoradh ar laghdú ar na víris cosanta nó ar phages, rud a fheictear i gcomhthéacs IS tar éis tx duáin. Féadfaidh seicheamhú metagenomic na speiceas víreasach nua a fhaightear in othair tx faoi IS a aithint má d'athraigh nochtadh IS patrúin friotaíochta nó resistome cuid de na víris, go háirithe iad siúd atá níos mó seans maith athlasadh agus díolúine a thiomáint (16). Tá sé léirithe go laghdaíonn cóireáil nanoparticle airgid daonraí víreasacha agus baictéaracha gut atá pro-athlastach (46). D’fhéadfadh go mbeadh níos mó seans ag micribhithóim mhucinophilic imdhíonacht chosanta neamhóstach a sholáthar, agus d’fhéadfadh cailliúint aon víris/miocróib eosinophilic le IS a bheith ina thiománaí freisin don riosca méadaithe cistitis agus ionfhabhtuithe conartha urinary a fheictear in othair tar éis tx.

Trasnaíonn an micribhithóim le stáit sláinte agus galair. Is ábhar iontais é braite nua líon mór víreas a úsáidtear mar lotnaidicídí/feithidicídí. Léiríonn aithint víris nach bhfuiltear ag súil go mbeidh siad sa fual go bhféadfaí dul isteach i gcórais choirp trí ionghabháil (éilliú bia, uisce nó deochanna eile amhail bainne) nó trí ionsú cutaneous (eg, níocháin láimhe míchuí) a bheith ann. Go deimhin, de réir an dlí feidearálach, aithnítear agus glactar le hiarmhair beag de lotnaidicídí/éilliú feithidicíde i mbia daonna (41, 47), cé nár scrúdaigh éinne go dtí seo a láithreacht i bhfual. Is féidir freisin go ndéanann na víris seo coilíniú nó ionradh ar an gconair urinary trí ionfhabhtú ardaitheach, go háirithe i gcomhthéacs IS in othar tx duáin, áit a bhfuil cosaint imdhíonachta íslithe óstaigh.

Aithneofar níos fearr na torthaí seo trí mheastóireacht a dhéanamh ar an stór virome daonna i gcohóirt éagsúla geografacha agus déimeagrafacha na n-othar a bhfuil cúiseanna éagsúla gortaithe duáin acu má bhaineann an t-othar go sonrach le stór áirithe próitéiní víreasacha a breathnaíodh sa staidéar seo, a tíreolaíocht, a gcuid déimeagrafaíocht, nó an fochineál galar duáin. Is féidir le staidéir bhailíochtaithe bhreise trí thástálacha PCR víreasacha fuail foráil a dhéanamh do mheasúnú tapa ar thionchar cliniciúil na víris seo i gcohóirt eile gortaithe duánach. Suimiúil go leor, i stór na n-peptídí víreasacha aitheanta, níor thugamar faoi deara aon phages. Tá sé seo curtha i leith na modheolaíochta a úsáidtear le haghaidh ullmhú peptide ó fhual ollnóva, nach bhfuil a ghabháil baictéir (a fháil pelleted amach), óstach víris phage (48). Níor aithin an tuarascáil virome bunaithe ar anailís seicheamh DNA freisin phages sa tuarascáil foilsithe (19). Thuairiscigh an staidéar virome fual a d'úsáid aonrú baictéarophage íonaithe ag baint úsáide as grádán dlúis clóiríd caeisiam aithint phages (20). Tacaíonn na hailt seo go léir go mbíonn tionchar ag modheolaíocht an ullmhúchán samplach ar na torthaí deiridh.

Tá cur síos agus staidéar maith déanta ar choilíniú, ar fhriotaíocht, agus ar éiceolaíocht mhiocróbach i gcomhthéacs ionfhabhtuithe miocróbacha (49), agus tá sé léirithe go bhfuil cóireáil antaibheathach (i gcomhthéacs cóireáil a dhéanamh ar ionfhabhtuithe sna hainmhithe a fhoirmíonn táirgí bia nó mar chuid den Cuireann próifiolacsas antiviral d'othair tx sa chéad 3-6 mhí iar-tx) deireadh le go leor speiceas baictéarach agus víreasach comhchoiteann as an gut agus sreabhán coirp eile agus laghdaíonn sé cosaint frithmhiocróbach (50). Cruthaíonn coilíniú le micribhiota go luath sa saol an córas imdhíonachta agus cruthaíonn sé deis do staid homeostatach, a d'fhéadfadh cur le hathlasadh má chuirtear isteach air, i gcomhthéacs tx agus IS. B'fhéidir gur mhaith le cur chuige beachtais sa todhchaí teiripe a shaincheapadh ó chur chuige "microbiota-lárnach" agus "óstach-lárnaithe" i leith leigheas beachtais. Go dtí le déanaí, níor thugamar mórán airde ar mhicribhithóim bia agus ar an tuiscint go bhféadfadh go leor ionfhabhtuithe atá ag teacht chun cinn a bheith veicteoirithe ag bianna. Iarrachtaí reatha chun uirlis rianaithe meitigenome a fhorbairt a dhéanfaidh meastóireacht ar thionchar na n-ionfhabhtuithe éagsúla — baictéarach, víreasach, agus fungasach agus a méarloirg i gcomhthéacs an bhia a ithimid, a bhféadfadh tionchar a bheith aige ar theocht chomhthimpeallach, ar chohórt ainmhithe, ar dhroch-chúis marthanais, agus cleachtais talmhaíochta lena n-áirítear cóireáil ithreach (cóireáil bróimíd meitile na hithreach mar thoradh lotnaidicídí i méadú ollmhór ar speicis Bacillus), foinsí uisce [ualaí miocróbach éagsúla i lochán vs uisce tobair (51)], géineolaíocht na saothróg plandaí bia go d’fhéadfadh go n-athrófaí cosaint plandaí ar mhiocróib, ar phlandaí agus ar lotnaidicídí (51). D’fhéadfadh lipoproteiní víreasacha agus baictéaracha a bheith freagrach as airíonna imdhíonachta-mhodúlach, agus tugann staidéir a rinneadh le déanaí le fios freisin go bhfuil ról ag idirghníomhú díolúine dúchasach maidir le héagsúlacht micribhithóim a rialáil agus ionfhabhtú a rialú, ag línte cille sonracha ar nós cealla T athraithigh mucosal (cealla MAIT). Mar sin, beidh sé ríthábhachtach staidéir bhreise a dhíríonn ar éagsúlacht mhiocróbach fíocháin daonna agus a tionchar ar athlasadh agus ar fhreagairtí imdhíonachta a dhéanamh mar chuid de thaighde amach anseo.

CÓIREÁIL GALAIR DUAN: CISTANCHE

RÁITEAS EITIC

Bailíodh na samplaí staidéir go léir ó fhaighteoirí péidiatraiceacha agus daoine fásta óga a trasphlandaíodh idir na blianta 2000 agus 2011 ag Ospidéal Leanaí Lucile Packard in Ollscoil Stanford. D'fhormheas coistí eitice Scoil Leighis Ollscoil Stanford agus Ionad Leighis UCSF an staidéar. Thug gach othar aosach agus tuismitheoir/caomhnóir othar neamhaosaigh toiliú feasach i scríbhinn chun páirt a ghlacadh sa taighde, ag cloí go hiomlán le Dearbhú Heilsincí.

RANNÍOCAÍOCHTAÍ AN ÚDAR

Ghlac MS agus TS páirt i ndearadh an staidéir; Ghlac SN, TS, NM, agus MS páirt i scríobh an ailt agus i léirmhíniú na dtorthaí; Rinne NM na hanailísí staitistiúla agus meastóireacht ar thorthaí; Ghin agus phróiseáil CN, KB-J, agus W-JQ na sonraí amh.

MAOINIÚ

Admhaímid tacaíocht ó Ollscoil California San Francisco. Admhaíonn na húdair an tacaíocht mhaoinithe ó NIDDK R01DK083447 (go MS), DP3 DK110844 (W-JQ), agus P41 GM103493 (W-JQ).

CÓIREÁIL GALAIR DUAN: CISTANCHE

TAGAIRT

1. Potgieter M, Bester J, Kell DB, Pretorius E. An microbiome fola díomhaoin i galair ainsealacha, athlastacha.FEMS Micribhith Athr(2015) 39(4):567–91. doi:10.1093/baineann/fuv013

2. Zhang Y, Zhao F, Deng Y, Zhao Y, Ren H. Anailís metagenomic agus meitibileach ar éifeachtaí tocsaineacha an mhicribhithóim gut trí-cloroacetamide-spreagtha agus suaitheadh ​​​​metabolome fual i lucha.J Proteome Res(2015) 14(4):1752–61. doi:10.1021/pr5011263

3. Lewis DA, Brown R, Williams J, White P, Jacobson SK, Marchesi JR, et al. Micribhithóim urinary an duine; DNA baictéarach i bhfual neamhní daoine fásta asymptomatic.Tosaigh cill Infect Micribhith(2013) 3:41. doi:10.3389/fcimb.2013.00041

4. Fouts DE, Pieper R, Szpakowski S, Pohl H, Knoblach S, Suh MJ, et al. Déanann seicheamhú comhtháite den chéad ghlúin eile de 16S rDNA agus meiteapróitéamaíocht idirdhealú a dhéanamh ar mhicribhithóim fuail sláintiúil ó bhaictéir asymptomatic i lamhnán néaróipeach a bhaineann le gortú chorda an dromlaigh.J Aistrigh Med(2012) 10:174. doi:10.1186/1479-5876-10-174

5. Lim Y, Totsika M, Morrison M, Punyadeera C. Is beag tionchar a bhíonn ag na modhanna bailiúcháin nó ag prótacail eastóscadh DNA ar phróifílí micribhithóim saliva.Sci Ionadaí(2017) 7(1):8523. doi:10.1038/s41598-017-07885-3

6. Nasidze I, Quinque D, Li J, Li M, Tang K, Stoneking M. Anailís chomparáideach ar éagsúlacht microbiome saliva daonna trí phiroseicheamhú barrachóidithe agus cur chuige clónála.Anal Bithcheimic(2009) 391(1):64–8. doi:10.1016/J.ab.2009.04.034

7. Wang Y, Kasper LH. Ról an mhicribhithóim i neamhoird lárchóras na néaróg.Inchinn iompar Imdhíonachta(2014) 38:1–12. doi:10.1016/j.bbi.2013.12.015

8. Lee SH, Sung JY, Yong D, Chun J, Kim SY, Song JH, et al. Tréithriú an mhicribhithóim i sreabhán lavage bronchoalveolar othar a bhfuil ailse scamhóg orthu i gcomparáid le loit neamhurchóideacha cosúil le mais.scamhóg Ailse(2016) 102:89–95. doi:10.1016/j.lungcan.2016.10.016

9. Twigg HL III, Morris A, Ghedin E, Curtis JL, Huffnagle GB, Crothers K, et al. Úsáid lavage bronchoalveolar chun an micribhithóim riospráide a mheas: comhartha sa torann.Lancet Riospráide Med(2013) 1(5):354–6. doi:10.1016/S2213-2600 (13)70117-6

10. Cuibhreannas Tionscadal Micribhithóim Daonna. Creat le haghaidh taighde ar mhicribhithóim daonna.Dúlra(2012) 486(7402):215–21. doi:10.1038/nature11209

11. Kroemer A, Elsabbagh AM, Matsumoto CS, Zasloff M, Fishbein TM. An micribhithóim agus a impleachtaí maidir le trasphlandú intestinal.Curr Tuairim Orgán Trasphlandú(2016) 21(2):135–9. doi: 10.1097/MOT.0000000000000278

12. Weber D, Oefner PJ, Hiergeist A, Koestler J, Gessner A, Weber M, et al. Léiríonn leibhéil ísle shulfáit indocsaile fuail go luath tar éis trasphlandúcháin miocróibim suaite agus baineann siad le drochthoradh.Fuil(2015) 126(14):1723–8. doi:10.1182/fola-2015-04-638858

13. Vindigni SM, Surawicz CM. Micribhithóim an phutóige: imreoir atá suntasach go cliniciúil sa trasphlandú?Saineolaí Athr Clin Imdhíonól(2015) 11(7):781–3. doi:10.158 6/1744666X.2015.1043894

14. Becker J, Poroyko V, Bhorade S. Micribhithóim na scamhóg tar éis trasphlandú scamhóg.Saineolaí Athr Riospráide Med(2014) 8(2):221–31. doi:10.1586/17476348.20 14.890518

15. Hartman AL, Loch DM, Barupal DK, Fiehn O, Fishbein T, Zasloff M, et al. Glacann micribhithóim gut daonna staid mhalartach tar éis trasphlandú bputóg beag.Proc Natl Acad Sci U S A(2009) 106(40):17187–92. doi:10.1073/pnas.0904847106

16. Nochtann Rani A, Ranjan R, McGee HS, Andropolis KE, Panchal DV, Hajjiri Z, et al.Urinary microbiome na n-othar trasphlandúcháin duáin dysbiosis a bhfuil acmhainneacht le haghaidh frithsheasmhacht in aghaidh antaibheathach.Aistrigh Res(2017) 181:59–70. doi:10.1016/j. tsl.2016.08.008

17. Fricke WF, Maddox C, Amhrán Y, Bromberg JS. Tréithriú microbiota daonna le linn trasphlandú duánach.Táim J Trasphlandú(2014) 14(2):416–27. doi:10.1111/ajt.12588

18. Lee JR, Muthukumar T, Dadhania D, Toussaint NC, Ling L, Pamer E, et al. Struchtúr pobail mhiocróbaigh gut agus aimhréidh tar éis trasphlandú duáin: staidéar píolótach.Trasphlandú(2014) 98(7):697–705. doi: 10.1097/ TP.0000000000000370

19. Rani A, Ranjan R, McGee HS, Metwally A, Hajjiri Z, Brennan DC, et al. I virome éagsúil in othair trasphlandúcháin duán tá ilfhochineálacha víreasacha le ilmhoirfeachtaí ar leith.Sci Ionadaí(2016) 6:33327. doi:10.1038/srep33327

20. Santiago-Rodriguez TM, Ly M, Bonilla N, Pride DT. Tá baint ag virome fual an duine le hionfhabhtuithe sa chonair urinary.Tosaigh Micribhith(2015) 6:14. doi:10.3389/fmicb.2015.00014