Tionchar Iontógáil Ard Salainn ar Éiceachóras Inní Nádúrtha i Lucha Fiáin

Teibí: Tá pobal baictéarach coimpléascach frithpháirteach idirspleách ag an holobiont mamach. Is eol go bhfuil athruithe i gcomhdhéanamh an chuibhreannais bhaictéaraigh seo ina bpríomhghné i sláinte, díolúine agus galair óstaigh. I measc go leor eile, bíonn tionchar ag nósanna aiste bia chun cur isteach ar an idirghníomhaíocht fhrithpháirteach baictéar-óstach. Sa chomhthéacs seo, léirigh muid roimhe seo go bhfuil riocht dysbiotach de mhicribhiota gut murine mar thoradh ar aiste bia ard-salann (HSD), arb iad is sainairíonna é laghdú nó ídiú na mbaictéar putóige a chothaíonn sláinte a bhfuil aithne mhaith orthu. Mar sin féin, mar gheall ar thimpeallacht rialaithe agus sláintithe, tá micreabhiota gut níos lú éagsúil ag lucha traidisiúnta saotharlainne (CLM) i gcomparáid le lucha fiáine, rud a fhágann drochthorthaí aistritheacha do staidéir mhicribhithóim gut, ós rud é go bhféadfadh go dteipfeadh ar éagsúlacht laghdaithe gut microbiota an casta idirspleách a léiriú. líonraí an mhicribhithóim. Anseo, rinneamar measúnú ar an éifeacht HSD ar mhicribhiota putóige i CLM i gcomparáid le lucha fiáin, a bhfuil éiceachóras putóige nádúrtha ag déanamh aithrise níos dlúithe ar staid an duine. Cóireáladh lucha le bia rialaithe nó HSD agus rinneadh próifíliú ar mhiocróibítí gut trí úsáid a bhaint as modhanna bunaithe ar aimplión a dhírigh ar ghéin ribosómach 16S. Ag teacht le torthaí roimhe seo, léirigh ár dtorthaí gur tharraing HSD caillteanas suntasach ar éagsúlacht alfa agus modhnú fairsing ar chomhdhéanamh micribiota gut i CLM, arb iad is sainairíonna é an laghdú ar bhaictéir a d’fhéadfadh a bheith tairbheach ó Firmicutes phylum mar na genera Lactobacillus, Roseburia, Tuzzerella, Anaerovorax agus méadú ar Akkermansia agus Parasutterella. Mar sin féin, níor léirigh lucha fiáin cóireáilte HSD na hathruithe céanna i dtéarmaí éagsúlachta alfa agus caillteanas baictéir Firmicutes agus CLM, agus níos ginearálta, níor léirigh fiadhúlra ach mionathruithe i gcomhdhéanamh microbiota gut ar HSD. Ag teacht leis seo, níor mhol an anailís fheidhmiúil bunaithe ar 16S ach athruithe móra ar fheidhmeanna éiceolaíochta gut microbiota i CLM i gcomparáid le lucha fiáin ar HSD. Tugann ár dtorthaí le fios go bhfuil micribhiota gut níos saibhre agus atá díorthaithe go fiáin níos frithsheasmhach in aghaidh idirghabhálacha aiste bia mar HSD, i gcomparáid le micribiota gut CLM, a bhféadfadh impleachtaí tábhachtacha a bheith aige do thaighde aistritheach micribhithóim amach anseo.

cistanche tubulosa-feabhas a chur ar chóras imdhíonachta

Keywords: micribhithóim; aiste bia ard-salann; díolúine ; ag fiuchadh

1. Réamhrá

Tá pobal baictéarach casta agus éagsúil coilínithe ag gut na mamaigh, a chruthaíonn caidreamh siombóiseach íogair in éineacht leis an ósta [1,2]. Feidhmíonn an pobal baictéarach seo go leor feidhmeanna úsáideacha don óstach, lena n-áirítear feidhmeanna meitibileach, inmunomodulating, agus trófacha [3-7] agus d'fhéadfadh comhdhéanamh microbiota gut athrú le linn an tsaoil, ag teacht le riachtanais shonracha agus fiseolaíocht an óstaigh [1,8, 9]. Déanann meitibilítí anaeróbach a dhíorthaítear ó choipeadh [10–13] a idirghabháil go leor feidhmeanna tairbhiúla na mbaictéar a chothaíonn sláinte putóige agus d’fhéadfadh tionchar suntasach a bheith ag coinníollacha dysbiotic ar shláinte an óstaigh [2,11,14,15]. Mar gheall ar an imní atá ag dul i méid maidir le tionchar stíl mhaireachtála ar an tsláinte, tá méadú tagtha ar spéis eolaíoch i rannpháirtíocht micribiota putóige agus a impleachtaí aistrithe [16,17]. Go deimhin, tá an microbiota gut múnlaithe ag fachtóirí eistreach (m.sh., stíl mhaireachtála, aiste bia, agus cóireálacha leighis) agus intreacha (eg, géineolaíocht óstaigh, rialacháin imdhíonachta agus meitibileach) [8,18-20]. Aithnítear go ginearálta go bhféadfadh éifeachtaí tionchair a bheith mar thoradh ar ghnéithe eistreacha, agus go mbeadh aiste bia ar cheann de na príomhfhachtóirí a chuireann isteach ar chomhdhéanamh agus ar fheidhm na micribiota gut [1,2,21]. Is eol go ndéanann comhpháirteanna aiste bia an Iarthair, cosúil le hiontógáil ard salainn, hoiméastáis óstaigh a ghortú trí dhul i bhfeidhm ar an gcóras imdhíonachta agus trí mhicribhiota agus galar an gut a athrú [18,22-37]. I micribiota gut murine, tá baint ag aiste bia ard-salann (HSD) le laghdú na mbaictéar a chothaíonn sláinte ar a dtugtar táirgeoirí aigéid sailleacha gearrshlabhra (SCFA) mar Lactobacillus spp., Bifidobacterium, Blautia agus Faecalibaculum [28, 29,38-41], in éineacht le méadú ar fhlúirse Akkermansia, táirgeoir failleach SCFA eile a léiríodh go gcuireann sé isteach ar dhíolúine óstach agus galair i gcórais mhúnla éagsúla [42,43]. Is minic a úsáidtear samhlacha ainmhithe murine chun staidéar a dhéanamh ar an gcaoi a bhféadfadh fachtóirí aiste bia an gut microbiota, an córas imdhíonachta agus an galar a mhúnlú [29,44-46]. Cé go bhfuil úsáid lucha saotharlainne traidisiúnta (CLM) fós ina rogha bhailí le haghaidh go leor staidéar, uaireanta ní dhéantar feidhmchláir atá dírithe ar mhiocróibítíní gut a aistriú i gceart [47–49]. Mar shampla, léiríodh go raibh drochthuar ag taighde imdhíoneolaíoch agus meitibilít i múnlaí murine de ghalar putóige athlastach (IBD) agus murtall torthaí aistritheacha staidéir ar mhicribhiota gut [50]. D'fhéadfadh sé seo a bheith mar gheall ar go leor difríochtaí dúchasacha sna córais mhúnla seo, mar shampla anatamaíocht gut difriúil, géineolaíocht, agus fiseolaíocht [16,50]. Mar sin féin, fadhb eile a bhaineann le CLM a úsáid chun staidéar a dhéanamh ar idirghníomhaíochtaí microbiota-imdhíonachta ná baileú comhdhéanamh baictéarach gut i CLM, rud a léirítear i laghdú ar chastacht agus ar athléimneacht an mhicrobiota gut CLM i gcomparáid le lucha fiáine [51]. Mar gheall ar an ngá atá le timpeallachtaí sláintithe agus rialaithe tá láithreacht laghdaithe pataiginí agus paraisítí ionchasacha, rud a chreidtear dá bharr sin a bheith mar thoradh ar chóras imdhíonachta nach bhfuil chomh “oideachasúil” i CLM i gcomparáid le lucha fiáine [51–53]. Chun aghaidh a thabhairt ar an bhfadhb seo, d’fhorbair C57BL/6 an tsamhail murine fiáin le haistriú sutha díorthaithe ó lucha C57BL/6 isteach i lucha fiáine chun micribhiota guta de bhunadh fiáin a fháil, chun saincheist aistritheach na staidéar imdhíoneolaíoch-gut a shárú [54]. Léirigh staidéir le déanaí a bhain leis an tsamhail luch seo torthaí níos fearr maidir le luach aistritheach imdhíonteiripeanna turgnamhacha a thuar i gcomparáid le CLM [54,55]. Ina theannta sin, bhí micreabhiota gut fiáin níos resistant agus níos athléimní do chóireáil antaibheathach agus aiste bia ard-saill i gcomparáid le CLM, inchomparáide leis an staid níos casta i ndaoine [54,55]. Mar sin féin, in ainneoin na n-éifeachtaí seanbhunaithe atá ag HSD ar mhicribhiota gut, ar an gcóras imdhíonachta, agus ar mhúnlaí galair éagsúla i CLM, ní fios cén tionchar a bhíonn ag iontógáil ard-salainn ar mhiocróibít nádúrtha, díorthaithe guta. Sa staidéar seo, rinneamar measúnú ar éifeacht HSD ar chomhdhéanaimh éagsúla éiceachórais bhaictéarach putóige agus feidhmeanna réamh-mheasta CLM i gcomparáid le lucha fiáin.

2. Ábhair agus Modhanna

2.1. Ainmhithe agus Aiste Bia

Ceannaíodh lucha de chineál fiáin C57BL/6 (baineann 7–8 seachtaine d’aois, n=20) ó Charles River agus coinníodh iad i saoráid ainmhithe Ollscoil Hasselt faoi choinníollacha caighdeánaithe. Coinníodh lucha fiáine (cúlra géiniteach C57BL/6, fireannaigh n=12 agus baineannaigh n=11) [54] i saoráid ainmhithe UHasselt faoi choinníollacha caighdeánaithe. D’fhormheas an Coiste Eiticiúil um Turgnaimh Ainmhithe (ECAE) in Ollscoil Hasselt (ID201618A4V1, ID202235) staidéir ar ainmhithe. Coinníodh lucha (4 lucha/cage) i seomra rialaithe teochta (21–23 ◦C) le timthriall éadrom 12:12 h/éadrom dorcha. Ceannaíodh na aistí bia íonaithe seo a leanas ó Ssniff (Soest, an Ghearmáin): 0.5% NaCl/control diet (E15430-04), agus 4% NaCl/HSD (E15431-34). Maidir le HSD, chothaíodh ainmhithe le 1% NaCl san uisce óil chomh maith le E15431-34, mar a thuairiscítear in [28]. Scaipeadh lucha CLM go cothrom idir an grúpa rialaithe (n=10) agus HSD (n=10). Maidir leis na lucha fiáine, dáileadh daoine fireanna agus baineanna go cothrom freisin i ngrúpaí rialaithe agus i ngrúpaí cothaithe HSD (6 fhear le haghaidh rialaithe, 6 fhir le haghaidh HSD, 5 baineannaigh le haghaidh rialaithe, agus 6 baineannaigh le haghaidh HSD).

cistanche córas imdhíonachta a mhéadú plandaí

2.2. Eastóscadh DNA

Rinneadh eastóscadh DNA miocróbach mar a thuairiscítear i [28], trí úsáid a bhaint as prótacal modhnaithe den QIAmp Fast DNA Stool Mini Kit (Qiagen, Hilden, an Ghearmáin). Go hachomair, cuireadh millíní fecal le 2-mL Eppendorf ina raibh 0.5 mm coirníní gloine agus 1.5 mL de mhaolán lysis (ASL) (Qiagen, Hilden, an Ghearmáin). Baineadh úsáid as bead-beating chun homogenization meicniúil na millíní a dhéanamh. Rinneadh eastóscadh iomlán de réir phrótacal an mhonaróra le mionathruithe (síneadh an t-am goir proteinase K go 2 h ag 70 ◦C). Rinneadh measúnú ar thiúchan DNA trí úsáid a bhaint as speictreafótaiméadar NanoDrop ND-1000 (NanoDrop Technologies, Wilmington, DE, USA) agus a stóráil ag −20 ◦C roimh aimpliú géine rRNA 16S.

2.3. 16S rRNA Aimpliú agus Seicheamhú Géine

Méadaíodh seicheamh géine rRNA 16S trí úsáid a bhaint as primer sonrach don réigiún V4 (F515 / R806), mar a thuairiscítear roimhe seo [56]. Go hachomair, úsáideadh 25 ng de DNA in aghaidh imoibriú PCR (30 µL) (KAPA HiFi HotStart ReadyMix, Roche, Basel, CH, SAM) den dínádúrú tosaigh le haghaidh 30 s ag 98 ◦C, agus 25 timthriall ina dhiaidh sin (10 s ag 98 ◦ C, 20 s ag 55 ◦C, agus 20 s ag 72 ◦C). Rinneadh frithghníomhartha trí chóip, arna gcomhthiomsú in aghaidh an tsampla, agus íonaithe ag córas glantacháin mhaighnéadach bunaithe ar choirníní (Agencourt AMPure XP, Beckman Coulter, Brea, CA, SAM). Rinne PCR timthriall teoranta ullmhúchán na leabharlainne chun an leabharlann innéacsaithe a fháil ag baint úsáide as teicneolaíocht Nextera (Kit Innéacs Nextera XT, Illumina, San Diego, CA, SAM), agus an dara céim glantacháin coirníní maighnéadacha AMPure XP ina dhiaidh sin. Ansin normalaíodh samplaí innéacsaithe go dtí an tiúchan céanna de 4nM, comhthiomsaíodh iad agus seicheamhaíodh iad ar ardán Illumina MiSeq PE300 le prótacal deireadh péireáilte 2 × 300 bp de réir prótacal na cuideachta (Illumina, Inc., San Diego, CA, SAM).

cistanche tubulosa-feabhas a chur ar chóras imdhíonachta

Cliceáil anseo chun táirgí Cistanche Feabhsú Díolúine a fheiceáil

【Iarr tuilleadh】 Ríomhphost:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692

2.4. Próiseáil agus Anailís Staitistiúil ar Shonraí Seicheamhaithe Géine 16S rRNA

Próiseáladh seichimh amh ag baint úsáide as píblíne QIIME 2 [57]. Tar éis scagadh faid agus cáilíochta (paraiméadar réamhshocraithe), rinneadh léamha a scagadh agus a shannadh d'aonaid tacsanomacha oibriúcháin (OTUanna) ag baint úsáide as DADA2 [58]. Rinne an t-algartam VSEARCH (https://github.com/torognes/vsearch; rochtain air an 9 Samhain 2{022) an tasc tacsanomaíoch agus bunachar sonraí Silva v128 ( https://www.arb-silva.de /; rochtain air an 9 Samhain 2{{40}}22). Ansin normalaíodh an tábla ASV trí rarefaction ag doimhneacht 6.147 ionas gur shroich gach sampla an ardchlár ag deireadh an chuar rarefaction. Rinneadh measúnú ar alfa-éagsúlacht ag baint úsáide as dhá mhéadracht dhifriúla: innéacsanna éiceolaíochta saibhreas OTUs (Breathnaithe), Chao1, Shannon, Simpson, Inverse Simpson (InvSimpson). Maidir le héagsúlacht béite, ríomhadh agus breacadh éagothroime Bray-Curtis, cosúlacht Jaccard, agus méadracht UniFrac Ualaithe agus Neamhualaithe [59] le Anailís ar Chomhordanáidí Prionsabail (PCoA) chun an fíor-achar idir samplaí a fheiceáil. Chun an tábla comhairimh OTU a normalú, rinneadh annamh-dhréacht ag doimhneacht de 6305 sheicheamh in aghaidh an tsampla 100 uair. Úsáideadh an t-aschur a fuarthas ó sannadh tacsanomaíochta OTU, mar thábla tacsanomaíochta, chun tábla normalaithe OTU a laghdú ina tháblaí do na leibhéil tacsanomaíochta L2 (Phylum), L5 (Teaghlach), agus L6 (Géineas). Rinneadh anailís staitistiúil trí úsáid a bhaint as R (https://www.R-project.org/; rochtain ar an 25 Samhain 2022; Leagan 4.2.0). Baineadh úsáid as an bpacáiste R "vegan" (Leagan 2.6-4) [60] chun méadracht béite-éagsúlachta a ghiniúint chun difríochtaí comhdhéanamh grúpaí de réir PCoA nó de réir anailíse príomhchodanna (PCA) a chur i gcomparáid lena chéile. Rinneadh tástáil ar phacáistí agus scaradh sonraí trí thástáil iomalartaithe le cóimheasa pseudo-F (feidhm "Adonis" i "vegan"). Tástáladh deighilt i dtéarmaí éagsúlachta béite idir grúpaí ag Anailís Ilathraitheach Permutational ar Athraitheas ag Úsáid Cian-Mhaitrísí (PERMANOVA, feidhm "Adonis" in "vegan"), agus tástáladh difríochtaí maidir le scaipeadh laistigh de ghrúpaí trí thástáil scaipthe aonchineálachta Ilathróg (PERMDISP). , feidhm "betadisper" in "vegan"). Eisíodh tacsaithe nach raibh i láthair i 4 shampla ar a laghad ón anailís. Rinneadh measúnú ar dhifríochtaí i dtéarmaí flúirsí coibhneasta tacsaithe ar dtús leis an réamhthástáil Kruskal-Wallis idir 4 ghrúpa agus ansin rinneadh meastóireacht bhreise orthu leis an tástáil Wilcoxon idir na péirí comparáide seo a leanas: CLM Control vs CLM HSD, Wildling Control vs wildling HSD, CLM Control vs Rialú Fiáin, CLM HSD vs wildling HSD. Chun meastóireacht a dhéanamh ar dhifríochtaí tacsanomacha idir fiáin agus CLM, baineadh úsáid as Méid Éifeacht Anailíse Idirdhealaithe Líneach (LEfSe: https://huttenhower.sph.harvard.edu/galaxy/; rochtain air an 25 Samhain 2022) chun idirdhealú a dhéanamh idir na príomhghnéithe ag leibhéal an ghéineas [ 61]. Taispeánadh torthaí LEfSe ansin mar bharraghraf, le scór tairseach Anailíse Idirdhealaithe Líneach (LDA) níos airde ná 1.0. Nuair ba ghá, rinneadh coigeartú ar luachanna p na n-ilchomparáidí trí mhodh Benjamini-Hochberg. Measadh go raibh ráta fionnachtana bréagach (FDR) Níos lú ná nó cothrom le 0.05 suntasach go staitistiúil: * p Níos lú ná nó cothrom le 0.05; ** p Níos lú ná nó cothrom le 0.01; ***p Níos lú ná nó cothrom le 0.001. Rinne PICRUSt2, pacáiste bogearraí bithfhaisnéisíochta, anailís ar dhifríochtaí feidhmiúla idir micribhithóim d’ábhar NaCl éagsúla sa bhia (0.5% agus 4% ábhar bia NaCl) chun ábhar feidhme metagenome ó shonraí seicheamhaithe géine 16s rDNA a thuar (https://huttenhower.sph. harvard.edu/picrust/; rochtain air an 29 Samhain 2022; PICRUSt2 2.4.1) [62]. Cuireadh píblíne PICRUSt2 i bhfeidhm ar sheichimh ionadaíocha agus ar a dtábla flúirse ó DADA2 trí pharaiméadair chaighdeánacha a úsáid ( https://github.com/ picrust/picrust2/wiki/Full-pipeline-script ; rochtain air an 29 Samhain 2022). Ón aschur iomlán píblíne, tógadh réamh-mheastachán metagenomic do bhealaí KEGG Orthology agus MetaCyc mar tháblaí, le feidhmeanna réamh-mheastacháin mar sraitheanna agus samplaí mar cholúin, agus úsáideadh iad chun feidhmeanna micribiota guta i bhfiáin agus CLM a chur i gcomparáid le réimeas HSD. Roghnaíodh feidhmeanna thuarthacha pobail mhiocróbacha a chuir an chuid is mó leis an éagsúlacht idir fiáin agus CLM de réir an chéad (PC1), an dara (PC2), agus an tríú príomh-chomhpháirt (PC3) le haghaidh anailíse breise ar thomhaltas HSD sa dá mhúnla. Ansin normalaíodh an mhaitrís leis na flúirsí feidhm thuarthacha, a chlaochlú i luachanna an Chóimheas Logchomhad Láraithe (CLR), agus ríomhadh an cóimheas log2mean (HSD/Rialú) le haghaidh fiáin agus CLM araon. Ar deireadh, rinne Wilcoxon-test comparáid idir na cóimheasa log2mean idir grúpaí agus breacadh iad mar phlota cuneiform. Rinneadh comparáid staitistiúil ar dhifríochtaí idir grúpaí i mbogearraí R ag baint úsáide as feidhmeanna tástála Wilcoxon-test agus Kruskal-Wallis agus luachanna p arna gcoigeartú ag modh Holm nó Benjamini-Hochberg.

3. Torthaí

3.1. Bíonn tionchar ag HSD ar Éagsúlacht agus ar Chomhdhéanamh Micribhiota CLM agus Wildling Gut

Chun imscrúdú a dhéanamh ar thionchar HSD ar éiceachóras miocróbach putóige a dhíorthaítear go fiáin i lucha, thugamar bia HSD nó aistí bia rialaithe do lucha fiáine agus CLM. Coinníodh lucha ar réimeas aiste bia ar feadh dhá sheachtain agus rinneadh imscrúdú ar chomhdhéanamh microbiota fecal gut ina dhiaidh sin le seicheamh géine RNA 16S ó millíní fecal a bailíodh ag lá 14 (Fíor 1A). Ag teacht le tuarascáil roimhe seo, níor aimsíodh aon difríochtaí láidre i dtéarmaí meáchain choirp idir grúpaí rialaithe agus HSD de CLM agus lucha fiáine [29]. Chun measúnú a dhéanamh ar an microbiota gut difriúil idir an dá mhúnla CLM agus lucha fiáin ag bunlíne, rinneamar meastachán ar éagsúlacht alfa (Breathnaithe nó Richness, Chao1, Shannon, Simpson, agus Inverse Simpson innéacs), éagsúlacht béite (Bray−Curtis dissimilarity), agus an príomh. difríochtaí tacsanomacha. Ag teacht le staidéir roimhe seo [54], bhí saibhreas miocróbach níos mó mar thréith ag miocróib gut wildling (Fíor 1B, gach innéacs éagsúlachta alfa), chomh maith le comhdhéanamh miocróbach ar leith agus níos ilchineálach ná CLM (Fíor 1C, PERMANOVA p {{9}). }.001 & PERDISP p=0.0009, fiáin vs. CLM; agus Fíor S1). I dtéarmaí sínithe miocróbach, bhí tacsa baictéarach éagsúla (Fíor S1) mar shaintréith ag CLM agus miocróib gut lucha fiáine. Ar aon dul le Rosshart et al. [54], baineann tacsaithe baictéarach ó lucha fiáine le Intestinomonas, Desulfovibrio, Tuzzerella, Oscillobacter, Orodibacter, agus an ghéineas pataigineach Helicobacter, arb iad is sainairíonna iad próifíl neamhthírithe fiáine an tsamhail seo (Fíor S1).

Fíor 1. Tionchar HSD ar chomhdhéanamh baictéarach CLM (n=10/group) agus lucha fiáin (n=11 do fhiáin Ctrl agus n=12 do fhiáin HSD). (A) Dearadh turgnamhach. Cothaíodh C57BL/6 CLM nó lucha fiáin ar 0.5% NaCl (rialú, Ctrl) nó ard-salann 4% NaCl (HSD) agus gut pobail bhaictéarach guta arb iad is sainairíonna iad seicheamh aimplicon géine 16S rRNA. (B) Innéacsanna le haghaidh éagsúlacht alfa de mhicribhiota putóige fecal CLM agus fiáin; ó chlé go deas, taispeántar na hinnéacsanna seo a leanas: Breathnaithe (saibhreas AMACH), Chao1, Shannon, Simpson, Simpson (Inverse Simpson). Déanann tástáil Wilcoxon na difríochtaí idir grúpaí a mheas go staitistiúil. (C) Comhordaíonn Príomhoide plota anailíse ar chomhordú éagsúlachta béite ó Bray-Curtis méadrach neamhchosúlachta idir CLM vs wildling (barr), rialú CLM vs CLM HSD (bun ar chlé), agus rialú fiáin vs wildling HSD (bun ar dheis); ríomhadh deighilt agus aonchineálacht idir grúpaí trí thástálacha PERMANOVA agus PERMDISP faoi seach. * p Níos lú ná nó cothrom le 0.05; ** p Níos lú ná nó cothrom le 0.01; ****p Níos lú ná nó cothrom le 0.0001. Fíor 1. Tionchar HSD ar chomhdhéanamh baictéarach CLM (n=10/group) agus lucha fiáin (n=11 le haghaidh fiáin Ctrl agus n=12 le haghaidh fiáin HSD). (A) Dearadh turgnamhach. Cothaíodh C57BL/6 CLM nó lucha fiáin ar 0.5% NaCl (rialú, Ctrl) nó 4% NaCl (HSD) ard-salann agus gut pobail baictéarach gut arb iad is sainairíonna iad seicheamh aimplicon géine 16S rRNA. (B) Innéacsanna le haghaidh éagsúlacht alfa de mhicribhiota putóige fecal CLM agus fiáin; ó chlé go deas, taispeántar na hinnéacsanna seo a leanas: Breathnaithe (saibhreas AMACH), Chao1, Shannon, Simpson, Simpson (Inverse Simpson). Déantar difríochtaí idir grúpaí a mheas go staitistiúil ag tástáil Wilcoxon. (C) Comhordaíonn Príomhoide plota anailíse ar chomhordú éagsúlachta béite ó Bray-Curtis méadrach neamhchosúlachta idir CLM vs wildling (barr), rialú CLM vs CLM HSD (bun ar chlé), agus rialú fiáin vs wildling HSD (bun ar dheis); ríomhadh deighilt agus aonchineálacht idir grúpaí trí thástálacha PERMANOVA agus PERMDISP faoi seach. * p Níos lú ná nó cothrom le 0.05; ** p Níos lú ná nó cothrom le 0.01; ****p Níos lú ná nó cothrom le 0.0001.

Spreag HSD laghdú suntasach ar éagsúlacht baictéarach (Fíor 1B, gach innéacs éagsúlachta alfa) chomh maith le hathrú miocróbach suntasach i gcomhdhéanamh CLM (Fíor 1C, PERMANOVA p=0.001, PERMDISP p=0 .1, CLM Ctrl vs CLM HSD). I gcodarsnacht leis sin, bhí éagsúlacht níos airde ar HSD (Fíor 1B, innéacsanna Breathnaithe & Chao1) mar thréith ag micribiota gut lucha fiáine, go difriúil ó CLM, agus bhí siad chomh maith mar thréith ag aistriú comhdhéanamh miocróbach nach raibh chomh soiléir sin ar HSD i gcomparáid le CLM (Fíor 1C, PERMANOVA p=0.001, PERMDISP p=0.5, fiáin Ctrl vs. fiáin HSD).

3.2. Tá Comhdhéanamh Miocróbach Inní na Lucha Fiadhúlra Níos Frithsheasmhach in aghaidh HSD ná CLM

Ba shaintréith eile tacsanomaíoch iad na difríochtaí comhdhéanaimh baictéaracha idir fiáin agus CLM. Ag an leibhéal phylum, ba iad seo a leanas na phyla is flúirseach i dtéarmaí raidhse coibhneasta: Firmicutes (CLM: 52 ± 12%, fiáin: 32 ± 34%), Bacteroidota (CLM: 24 ± 23%, fiáin: 57 ± 19%), Actinobacteriota (CLM: 1{{10}} ± 7%, fiáin: 0.7 ± 1.3%) agus Verrucomicrobiota (CLM: 24 ± 23%, fiáin: 0%/gan braitheadh) (Fíor 2). Thaispeáin próifíl mhiocróbaigh an phutóige flúirsí éagsúla eile don fhiolas ar fad a braitheadh ​​i samplaí fecal idir lucha fiáin agus CLM (Fíor 2). Go háirithe, bhí difríocht shuntasach idir an dá mhúnla (Fíor 2). Go sonrach, ag leibhéal an teaghlaigh, breathnaíodh ranníocaíocht éagsúil i miocróib fhiáine vs CLM gut don chuid is mó de na baictéir a tuairiscíodh roimhe seo mar HSD íogair [28], lena n-áirítear Lactobacillaceae, Clostridiaceae, Peptostreptococcaceae, agus Akkermansiaceae (Fíor 3). Ag teacht leis seo, deimhníodh treochtaí comhchosúla ag leibhéal an ghéineas idir samplaí fiáine agus CLM do phríomhbhaill na dteaghlach thuasluaite; ina measc, ba iad Lactobacillus, Roseburia, Tuzzerella, Faecalibaculum agus Akkermansia (Figiúirí S1 agus 4) na cinn is ionadaí. Chun an tionchar a bhíonn ag HSD ar CLM agus ar chomhdhéanaimh micribiota putóige fiáine a shainiú tuilleadh, rinneamar anailís freisin ar thionchar an réimis chothaithe ag leibhéil éagsúla aicmithe. Ag an leibhéal fíolam, bhí ídiú suntasach Firmicutes agus saibhriú Verrucomicrobiota (Fíor 2) ag baint le microbiota gut CLM cóireáilte HSD, ach ní raibh aon tionchar ag HSD ar aon cheann de na príomhfhyla i samplaí fiáin (Fíor 2). Ag leibhéal an teaghlaigh, bhí ídiú suntasach ar bhaictéir a tháirgeann aigéid lachtaigh mar Lactobacillaceae, chomh maith le táirgeoirí SCFA mar Peptostreptococcaceae agus Clostridiaceae (Fíor 3). Ina theannta sin, i CLM a chothaítear le HSD, thugamar faoi deara méaduithe ar Akkermansiaceae, Sutterellaceae, Defluvitaleaceae, agus Eggerthellaceae (Fíor 3). I gcodarsnacht leis sin, chuir HSD isteach ar theaghlaigh bhaictéaracha éagsúla i micribiota putóige fiáine, ina measc an dá Muribaculaceae agus Prevotellaceae an-fhlúirseach, agus méadaíodh an dá cheann acu ar HSD (Fíor 3). I measc na modhnú baictéarach a chuir an chuid is mó le héifeacht HSD i CLM bhí méadú géine Akkermansia, Parasutterella, agus Enterorhabdus, chomh maith leis an laghdú ar Lactobacillus, Roseburia, Tuzzerella, (Eubacterium) grúpa oxidoreducens, Muribaculum agus Anaerovorax (Fíor 4). Ach amháin i gcás Roseburia, ní raibh aon tionchar ag HSD ar aon cheann de na gineacha thuasluaite i micribiota putóige fiáine, agus léirigh an ghéineas Anaerovorax claonadh contrártha ó ghéineas CLM (Fíor 4).

Fíor 2. Tionchar HSD ar fhíleáil bhaictéarach ó mhicribhiota putóige CLM (n=10/group) agus lucha fiáin (n=11 do fhiáin Ctrl agus n=12 do fhiáin HSD). Taispeántar comhdhéanamh iomlán i dtéarmaí flúirse choibhneasta phyla de réir barraphlota in aghaidh gach duine aonair (barr) agus boscaphlota le haghaidh phyla ar leith (bun); rinneadh comparáidí staitistiúla idir grúpaí ag Wilcoxon-test. * p Níos lú ná nó cothrom le 0.05; ** p Níos lú ná nó cothrom le {{10}}.01; ***p Níos lú ná nó cothrom le 0.001; ****p Níos lú ná nó cothrom le 0.0001.

Fíor 3. Tionchar tomhaltas bia ard-salainn ar theaghlaigh bhaictéaracha CLM (n=10/grúpa) agus lucha fiána (n=11 le haghaidh fiáin Ctrl agus n=12 le haghaidh fiáin HSD). Léirítear comhdhéanamh iomlán ag leibhéal an teaghlaigh ag barraphlota in aghaidh gach duine (ar an mbarr) agus boscaphlota do theaghlaigh ar leith (bun); rinneadh comparáidí staitistiúla idir grúpaí ag Wilcoxon-test. * p Níos lú ná nó cothrom le 0.05; ** p Níos lú ná nó cothrom le {{10}}.01; ***p Níos lú ná nó cothrom le 0.001; ****p Níos lú ná nó cothrom le 0.0001.

Fíor 4. Athruithe ar ghéinte baictéaracha i CLM (n=10/group) agus i lucha fiáin (n=11 le haghaidh fiáin Ctrl agus n=12 le haghaidh fiáin HSD). Déantar ranníocaíocht choibhneasta iomlán ag leibhéal an ghéineas a bhreacadh mar phlota barra ciorclach in aghaidh gach duine (ar a bharr) agus mar bhoscaphlota do ghéineanna sonracha (bun); rinneadh comparáidí staitistiúla idir grúpaí ag Wilcoxon-test. * p Níos lú ná nó cothrom le 0.05; ** p Níos lú ná nó cothrom le 0.01; ***p Níos lú ná nó cothrom le 0.001; ****p Níos lú ná nó cothrom le 0.0001.

3.3. Bíonn tionchar ag HSD ar Fheidhmeanna Miocróbacha Tuartha i CLM ach ní i Lucha Fiáin

Níor bhraith aschur PICRUSt 2 aon difríocht shuntasach idir feidhmeanna pobail mhiocróbacha HSD fiáin vs lucha fiáin neamhchóireáilte le haghaidh nótaí cosáin KEGG Orthology agus MetaCyc, cé is moite d’fheidhm mhéadaithe HSD-spreagtha ar ghéine recG do héileacaptar ATP-spleách ó Orthology KEGG (Fíor 5A). Ba shaintréith de thionchar HSD ar CLM laghdú suntasach ar fheidhmeanna réamh-mheastacháin do KEGG Orthology, ina measc an géine spp (siúcrós-6-phosphatase) agus pfkA (phosphofructokinase 1), an dá cheann a bhfuil baint acu le meitibileacht stáirse agus siúcróis, atá ag teacht. le torthaí roimhe seo [28] (Fíor 5A). Ina theannta sin, bhí an microbiota gut de CLM a chothaítear le HSD mar thréith ag feidhmeanna laghdaithe tuartha na ngéinte a bhaineann le hiompar membrane (feoB le haghaidh iompair iarainn, próitéin permease AB 2P AB 2, próitéin ceangailteach AB 2A AB 2 ATP), biosintéis glutamine (glnA). , rialtóir trascríobh teaghlaigh LacI (lacI, galR) agus transketolase (tktA, tktB) (Fíor 5A). Maidir le cosáin MetaCyc, shaibhrigh HSD go suntasach an microbiota gut CLM ar fheidhmeanna réamh-mheastacháin a bhaineann le laghdú níotráite (cosán dínitriúcháin), díghrádú galactóis (díghrádú D-galactarate, sár-chonair díghrádaithe D-glucarate agus D-galactarate), díghrádú feinile-própánáit, sailleacha. tarrthálas aigéad, díghrádú succinate go aigéad butanoic agus díghrádú aimínaigéad (díghrádú aimín aramatach, díghrádú L-leucine) (Fíor 5B). Ina theannta sin, ag teacht le torthaí roimhe seo [28], chaill HSD gut microbiota i CLM feidhmeanna réamh-mheastacháin le haghaidh bithsintéise aimínaigéad (superchonair bithsintéise L-alanine, biosintéis L-lísín), coipeadh aigéad measctha, le síniú úrscéal breise caillte mar N- díghrádú acetylglucosamine/N-acetyl-mannosamine/N-acetylneuraminate agus díghrádú deocsairbonucleóisídí (díghrádú pirimidín agus purín, bithshintéis inosine5phosphate III) (Fíor 5B).

Fíor 5. Ar lean.

Fíor 5. Éifeacht HSD ar fheidhmeanna meitigenómacha tuartha putóige i CLM (n=10/group) agus fiáin (n=11 le haghaidh fiáin Ctrl agus n=12 do fhiáin HSD) micribiota putóige. Aschur PICRUSt2 arna bhreacadh mar phlota cuneiform le haghaidh nóta Orthology KEGG (A) agus cosáin MetaCyc (B) arna shloinneadh mar mheánchóimheas log2 de na feidhmeanna réamh-mheastacháin idir samplaí HSD vs Ctrl. Rinneadh gach comparáid staitistiúil idir grúpaí Ctrl vs HSD ag Wilcoxon-test.

4. Plé

Is eol go bhfuil microbiota coimpléascacha agus ilchineálach i bhfiáin níos athléimní i leith samhlacha galair áirithe [51] agus réimeanna aiste bia, amhail iontógáil ard-saill [54,55]. Mar sin féin, níor rinne aon staidéar roimhe seo measúnú ar éifeachtaí iontógáil ard sóidiam ar mhicribhiota putóige murine de bhunadh fiáin. Anseo, rinneamar imscrúdú don chéad uair ar an gcaoi a dtéann HSD i bhfeidhm ar mhicriobiota gut fhiáin i gcomparáid le CLM. Is díol suntais é gur léirigh ár dtorthaí, i gcomparáid le CLM, go bhfuil an micribhithóim fhiáin níos resistant do shuaitheadh ​​HSD ag leibhéil feidhmiúla comhdhéanaimh agus thuarthacha araon. Tá sé bunaithe go maith go bhféadfadh iontógáil ard salainn an baol a bhaineann le galair éagsúla, amhail galair cardashoithíoch nó uath-imdhíonachta, a mhéadú trí chomhdhéanamh micribhithóim gut agus hoiméastáis imdhíonachta a athrú [25,29,31,34,63-65]. I gcomhréir le tuarascálacha roimhe seo, bhí athruithe suntasacha in éagsúlacht miocróbach, comhdhéanamh agus feidhmeanna réamh-mheastacháin mar thréith ag athruithe de bharr HSD i micribiota gut i CLM [28]. Laghdaigh baictéir a chothaíonn sláinte mar an teaghlach Peptostreptococcaceae agus genera Lactobacillus, Roseburia, agus Tuzzerella i dtéarmaí flúirse coibhneasta i CLM, agus tháinig méadú suntasach ar Akkermansia i ngrúpaí HSDfed. Bhraitheamar freisin flúirsí coibhneasta níos airde de HSD i Defluvitaleaceae, Enterorhabdus, agus Parasutterella. Suimiúil go leor, tá an ghéineas Parasutterella ina chomhpháirt lárnach de mhicribhiota gut CLM agus daoine araon, áit a n-iompraíonn sé mar tháirgeoir asaccharolytic agus succinate [66]. Is eol go bhfuil an dá Enterorhabdus ón teaghlach Eggerthellaceae agus Parasutterella ón teaghlach Sutterellaceae saibhrithe in othair le IBD [67,68], rud a léiríonn níos mó conas a d'fhéadfadh tionchar a bheith ag HSD ar fhorbairt galair. Go suimiúil, áfach, níor léirigh lucha fiáin aonán comhchosúil d’athruithe miocróbacha HSD-spreagtha, mar CLM. Ina ainneoin sin, mhéadaigh éagsúlacht fhiáin go suntasach ar HSD do mhéadracht OTUanna agus Chao1 a breathnaíodh, agus ní raibh baint ag ach cúpla tacsa le suaitheadh ​​an HSD ar mhicribhiota putóige fhiáin, ina measc méadú ar Anaerovorax, mar aon le laghdú Erysipelatoclostridium, Roseburia, agus Lachnospiracae. ghéineas UCG-004. Ba é Roseburia an t-aon síniú baictéarach a roinntear go coitianta idir grúpaí HSD i gcomparáid leis na rialuithe comhfhreagracha, in ainneoin go bhfuil raidhse níos airde de na baictéir seo fós ag baint le CLM a chothaítear le HSD i gcomparáid le lucha fiáin a chothaítear le HSD. Le tabhairt faoi deara, léiríodh go raibh raidhse coibhneasta níos ísle ag baictéir a tháirgeann butyrate cosúil le Roseburia in othair le colitis ulcerative [69] agus breathnaíodh an laghdú seo freisin a chomhghaolú le riosca géiniteach IBD na n-ábhar daonna [70]. Tá sé seo ag teacht le torthaí roimhe seo, nuair a fuarthas amach go raibh baint ag athruithe i ngéineas baictéarach mar Roseburia nó Lactobacillus le riosca Hipirtheannas, a d'fhéadfadh a bheith curtha chun cinn ag aiste bia an Iarthair [71]. Tá comhdhéanamh baictéarach an gut bainteach freisin le motility gut agus fiseolaíocht [72].

sochair cistanche do na fir-neartú chóras imdhíonachta

Breathnaíodh an ghéineas Anaervorax roimhe seo i lucha le fiseolaíocht gut neamhghnácha agus motility laghdaithe [73]; Mar sin féin, d'fhéadfadh ról difriúil a bheith ag an tacsa seo i gcomhthéacs hoiméastáis agus feidhm cheart mar thoradh ar shaibhriú Anaervorax in HSD do lucha fiáine. Ag teacht le torthaí roimhe seo, thugamar faoi deara méadú ar an ghéineas Akkermansia sa ghrúpa HSD de CLM [28], agus ídíodh an gut microbiota de lucha fiáine den ghéineas seo, atá comhsheasmhach freisin le staidéir níos luaithe ar an múnla seo [51, 53–55]. Cé go bhfuil an ghéineas Akkermansia ina probiotic féideartha mar gheall ar a éifeacht dhearfach ar fheabhas a chur ar phróifílí imdhíoneolaíocha agus meitibileach óstaigh (m.sh., i murtall agus diaibéiteas cineál 2) [42,74-77], níl ról an ghéineas seo soiléir fós mar gheall ar a dhiúltach. comhghaol le torthaí cliniciúla in ailse cholaireicteach [78], galar Parkinson [79,80] agus othair scléaróis iolrach [81]. Ag teacht lenár dtorthaí roimhe seo a fuarthas le cosáin MetaCyc [28], léirigh CLM ar HSD laghdú ar fheidhmeanna miocróbacha tuarthacha a bhaineann le meitibileacht stáirse agus siúcrós le haghaidh ointeolaíocht KEGG. Mar sin féin, níor éirigh leis na mion-aistrithe i gcomhdhéanamh baictéarach putóige lucha fiáin a chothaítear le HSD aon éagsúlachtaí suntasacha ar fheidhmeanna baictéaracha réamh-mheasta a spreagadh, rud a thugann le fios go bhfuil micribhiota putóige de bhunadh fiáin agus líonraí meitibileach/éiceolaíochta i bhfad níos cobhsaí agus go bhféadfadh siad oiriúnú i bhfad níos éasca. Athruithe cothaitheacha HSD-spreagtha i gcomparáid le héiceachórais gut CLM, a bhfuil gá le himscrúdú breise. Is fiú a lua freisin an tionchar a d’fhéadfadh a bheith ag an bpobal fungasach putóige ar líonra baictéarach na putóige ar réimeanna difreálacha aiste bia. Mhol staidéir níos luaithe cheana féin conas a bhíonn idirghníomhaíochtaí féideartha idir baictéir agus fungais bainteach le hoiméastáis an chórais imdhíonachta óstach agus forbairt galair [82-85]. Sa chomhthéacs seo, tá CLM teoranta tuilleadh ag a gcastacht baictéarach níos ísle i gcomparáid le lucha fiáine, a d'fhéadfadh bac a chur ar bhunú mycobiota gut éagsúil [54]. Beidh staidéir amach anseo in ann an méid a chuireann pobail fungacha putóige i suíomhanna de mhicribhiota putóige agus díolúine óstaigh a chinneadh trí úsáid a bhaint as an tsamhail fhiáin. Go hachomair, cuireann ár staidéar sonraí ar fáil ar an gcaoi a mbíonn tionchar ag iontógáil ard sóidiam ar éiceachóras miocróbach guta nádúrtha, a dhíorthaítear go fiáin i gcomparáid le pobal baictéarach putóige CLM. Léirigh ár staidéar nach ndéanann HSD difear do tacsaithe baictéarach agus micribiota putóige i lucha fiáine ar an mbealach céanna agus a dhéanann sé do mhicribhiota putóige ceansaithe ó CLM. Léiríonn an éagsúlacht seo, mar a luadh cheana maidir le réimeanna nó coinníollacha aiste bia eile amhail aistí bia ard-saill [54,55], go bhfuil gá le taighde sa todhchaí i gcórais mhúnla murine nádúrtha chun tionchar idirghabhálacha aiste bia ar éiceachórais chothaithe níos casta a athchaipitliú agus a mheas. mar atá i ndaoine.

cistanche tubulosa-feabhas a chur ar chóras imdhíonachta

Tagairtí

1. Candela, M. ; Biagi, E. ; Turroni, S.; Maccaferri, S.; Figini, P. ; Brigidi, P. Éifeachtacht dhinimiciúil an mhicribhiota intestinal daonna. Crit. An tUrr. Micribhith. 2015, 41, 165–171. [CrossRef] [PubMed]

2. Candela, M.; Biagi, E. ; Maccaferri, S.; Turroni, S.; Brigidi, P. Is fachtóir plaisteach é microbiota intestinal a fhreagraíonn d'athruithe comhshaoil. Treochtaí Microbiol. 2012, 20, 385–391. [CrossRef] [PubMed]

3. Boets, E. ; Gomand, SV; Deroover, L. ; Preston, T. ; Vermeulen, K.; De Preter, V. ; Hamer, HM; Van den Mooter, G.; De Vuyst, L.; Courtin, CM Infhaighteacht sistéamach agus meitibileacht aigéid shailleacha gearrshlabhra de dhroim coilíneachta in ábhair shláintiúla: Staidéar ar iseatóp cobhsaí. J. Fisiol. 2017, 595, 541–555. [CrossRef] [PubMed] 4. Tan, J.; McKenzie, C.; Potaimíteas, M. ; Thorburn, AN; Mac Aoidh, CR; Macia, L. Ról aigéid shailleacha gearrshlabhra i sláinte agus galair. Adv. Imdhíonól. 2014, 121, 91–119. [PubMed]

5. Kumar, J. ; Rani, K.; Datt, C. Nasc móilíneach idir snáithín chothaithe, microbiota putóige, agus sláinte. Mol. Biol. Ionadaí 2020, 47, 6229–6237. [CrossRef] [PubMed]

6. Bilota, AJ; Cong, Y. Rialú meitibilít microbiota gut ar chosaintí óstacha ag dromchlaí mucosal: Impleacht i míochaine bheachtais. Beacht. Clin. Med. 2019, 2, 110–119. [CrossRef]

7. Rooks, MG; Garrett, WS Gut microbiota, meitibilítí, agus díolúine óstaigh. Nát. Ath. Immunol. 2016, 16, 341–352. [CrossRef]

8. Rodríguez, JM; Murphy, K.; Stanton, C. ; Ros, RP; Kober, OI; Juge, N . ; Áibhsí, E.; Rudi, K.; Narbad, A. ; Jenmalm, MC Comhdhéanamh an mhicribhiota gut ar feadh an tsaoil, le béim ar an saol luath. Miocrób. Éacla. Sláinte Dis. 2015, 26, 26050. [CrossRef]

9. Arrieta, M.-C.; Stiemsma, LT; Amenyogbe, N. ; Donn, EM; Finlay, B. An micribhithóim intestinal sa saol luath: Sláinte agus galair. Tosaigh. Imdhíonól. 2014, 5, 427. [CrossRef]

10. Chung, WSF; Walker, AW; Louis, P.; Parkhill, J. ; Vermeiren, J. ; Bosscher, D.; Donnchadh, SH; Flint, HJ Is ag leibhéal an speicis a dhéantar modhnú ar mhicribhiota putóige an duine ag snáithíní aiste bia. Biol BMC. 2016, 14, 3. [CrossRef]

11. Danneskiold-Samsøe, NB; Barros, HDdFQ; Santos, R.; Bicas, JL; Cazarin, CBB; Madsen, L.; Kristiansen, K.; Pastore, GM; Brix, S.; Júnior, MRM Idirghníomhú idir bia agus microbiota putóige i sláinte agus galair. Bia Res. Int. 2019, 115, 23–31. [CrossRef] 12. Scott, KP; Donnchadh, SH; Flint, HJ Snáithín cothaithe agus micreabhiota an phutóige. Nutr. Tarbh. 2008, 33, 201–211. [CrossRef]

13. Donohoe, DR; Garáiste, N. ; Zhang, X. ; Grian, W. ; Ó Conaill, TM; Bunger, MK; Bultman, SJ Rialaíonn an micribhithóim agus an bhúitráit meitibileacht fuinnimh agus uathphagy sa colon mamach. Metab Cille. 2011, 13, 517–526. [CrossRef]

14. Gomaa, EZ Micribhiota/micreabiota putóige daonna i sláinte agus galair: athbhreithniú. Antonie Van Leeuwenhoek 2020, 113, 2019–2040. [CrossRef]

15. Requena, T.; Martínez-Cuesta, MC; Peláez, C. Aiste bia agus microbiota nasctha i sláinte agus galair. Feidhm Bia. 2018, 9, 688–704. [CrossRef] [PubMed]

16. Ericsson, AC; Franklin, CL Micribhithóim gut na lucha saotharlainne: Breithnithe agus cleachtais is fearr le haghaidh taighde aistritheach. Mamó. Géanóm 2021, 32, 239–250. [CrossRef] [PubMed]

17. Beresford-Jones, BS; Forster, SC; Stares, MD; Notley, G. ; Viciani, E.; Browne, HP; Boehmler, DJ; Soderholm, AT; Kumar, N.; Vervier, K. Leis an gCatalóg Baictéir Ghaistreintreacha Luiche is féidir aistriúchán a dhéanamh idir an luchóg agus micribiotas putóige daonna trí mhapáil fheidhmiúil. Miocrób Óstach Cill 2022, 30, 124–138.e8. [CrossRef]

18. Fabha, F. ; Rizzetto, L.; Tuohy, K. Micreabiota gut agus sláinte: Gníomhaithe a nascadh ar fud an chórais meitibileach. Proc. Nutr. Soc. 2019, 78, 177–188. [CrossRef]

19. David, LA; Materna, AC; Friedman, J.; Campos-Baptista, MI; Blackburn, MC; Perrotta, A. ; Erdman, SE; Bíonn tionchar ag stíl mhaireachtála Alm, EJ Host ar mhiocróbóit an duine ar scálaí ama laethúla. Géanóim Biol. 2014, 15, R89. [CrossRef]

20. Tanaka, M. ; Nakayama, J. Forbairt an mhicribhiota gut le linn na hóige agus a thionchar ar shláinte níos déanaí sa saol. Allergol. Int. 2017, 66, 515–522. [CrossRef]

21. David, LA; Muiris, CF; Carmody, RN; Gootenberg, DB; Cnaipe, JE; Wolfe, BE; Ling, AV; Devlin, AS; Varma, Y. ; Fischbach, MA Athraíonn aiste bia go tapa agus go in-atáirgthe micribhithóim gut an duine. Nádúr 2014, 505, 559–563. [CrossRef] [PubMed]

22. García-Montero, C. ; Fraile-Martínez, O.; Gómez-Lahoz, AM; Peaca, L. ; Castellanos, AJ; Noguerales-Fraguas, F.; Cóca, S.; Guijarro, LG; García-Honduvilla, N.; Asúnsolo, A. Comhpháirteanna cothaitheacha i réim bia an Iarthair i gcoinne aiste bia na Meánmhara ag idirghníomhú an chórais imdhíonachta gut microbiota. Impleachtaí do shláinte agus do ghalair. Cothaithigh 2021, 13, 699. [CrossRef] [PubMed]

23. Soverini, M. ; Rampelli, S.; Turroni, S.; Schnorr, SL; Quercia, S.; Castagnetti, A. ; Biagi, E. ; Brigidi, P.; Candela, M. Éagsúlachtaí i bpróifíl metagenome gut daonna iar-scoitheadh ​​mar thoradh ar fháil Bifidobacterium i micribhithóim an iarthair. Tosaigh. Micribhiol. 2016, 7, 1058. [CrossRef] [PubMed]

24. Manzel, A. ; Muller, DN; Hafler, DA; Erdman, SE; Nascóir, RA; Kleinewietfeld, M. Ról "aiste bia an Iarthair" i galair uath-imdhíonachta athlastacha. Curr. Ionadaí Ailléirge Asma 2014, 14, 404. [CrossRef] [PubMed]

25. Kleinewietfeld, M.; Manzel, A. ; Titze, J. ; Kvakan, H.; Yosef, N. ; Nascóir, RA; Muller, DN; Hafler, DA Tiomáineann clóiríd sóidiam galar autoimmune trí ionduchtú cealla TH17 pataigineach. Dúlra 2013, 496, 518–522. [CrossRef] [PubMed]

26. Haase, S.; Wilck, N.; Kleinewietfeld, M.; Müller, DN; Nascóir, RA spreagann clóiríd sóidiam uathdhíonacht idirghabhála Th17. J. Neuroimmunol. 2019, 329, 9–13. [CrossRef] [PubMed]

27. Hernandez, AL; Kitz, A. ; Wu, C. ; Lowther, DE; Rodriguez, DM; Vudatu, N.; Deng, S.; Herold, KC; Kuchroo, VK; Kleinewietfeld, M. Cuireann clóiríd sóidiam bac ar fheidhm shochtadh na gcealla rialála T FOXP3+. J. Clin. Imscrúdú. 2015, 125, 4212–4222. [CrossRef]

28. Hamad, I. ; Cairdilí, A. ; Corte-Real, BF; Dyczko, A.; Vangronsveld, J.; Kleinewietfeld, M. Cothaíonn Aiste Bia Ard-salann Ídiú Baictéir a Tháirgeann Aigéad Lachtaigh i Gut Murine. Cothaithigh 2022, 14, 1171. [CrossRef]

29. Wilck, N.; Matus, MG; Kearney, SM; Olesen, SW; Forslund, K.; Bartolomaeus, H.; Háise, S.; Mähler, A.; Balogh, A. ; Markó, L. Modhnaítear commensal putóige a fhreagraíonn do shalann TH 17 ais agus galair. Nádúr 2017, 551, 585–589. [CrossRef]

30. Wei, Y. ; Lu, C. ; Chen, J.; Cui, G. ; Wang, L.; Yu, T.; Yang, Y.; Wu, W. ; Ding, Y. ; Li, L. Spreagann aiste bia ard-salann freagairt Th17 gut agus cuireann sé níos measa ar choilitis TNBS-spreagtha i lucha. Oncotarget 2017, 8, 70. [CrossRef]

31. Sé, FJ; Li, J. ; MacGregor, GA Éifeacht laghdaithe salainn measartha fadtéarmach ar bhrú fola. Córas Bunachar Sonraí Cochrane. Ath. 2013, 346, f1325. [CrossRef] [PubMed]

32. Hu, L. ; Zhu, S.; Peng, X. ; Li, K.; Peng, W. ; Zhong, Y.; Kang, C. ; Cao, X.; Liu, Z.; Zhao, B. Spreagann ard-salann athlasadh inchinne agus mífheidhm chognaíoch, in éineacht le malairtí sa mhiocróibín gut agus laghdaigh táirgeadh SCFA. J. Alzheimer's Dis. 2020, 77, 629–640. [CrossRef]

33. Tubbs, AL; Liu, B. ; Rogers, TD; Sartor, RB; Miao, EA Níos measa salann aiste bia colitis turgnamhach. J. Imdhíon. 2017, 199, 1051–1059. [CrossRef]

34. Muller, DN; Wilck, N.; Háise, S.; Kleinewietfeld, M.; Linker, RA Rialaíonn sóidiam sa mhicrea-thimpeallacht freagraí imdhíonachta agus homeostasis fíocháin. Nát. Ath. Immunol. 2019, 19, 243–254. [CrossRef] [PubMed]

35. Burr, AH; Bhattacharjee, A.; Hand, TW Modhnú cothaitheach ar an micribhithóim agus freagairt imdhíonachta. J. Imdhíon. 2020, 205, 1479–1487. [CrossRef] [PubMed]

36. Roca-Saavedra, P.; Mendez-Vilabrille, V.; Miranda, JM; Nebot, C. ; Cardelle-Cobas, A.; Franco, CM; Cepeda, A. Breiseáin bia, éillithe, agus mion-chomhpháirteanna eile: Éifeachtaí ar mhicribhiota putóige an duine – athbhreithniú. J. Fisiol. Bithcheimic. 2018, 74, 69–83. [CrossRef]

37. Côrte-Real, BF; Hamad, I. ; Hornero, RA; Geisberger, S.; Roels, J. ; Van Zeebroeck, L.; Dyczko, A.; van Gisbergen, MW; Kurniawan, H. ; Wagner, A. Cuireann sóidiam isteach ar riospráid miteachondrial agus spreagann sé Tregs mífheidhmiúla. Metab Cille. 2023, 35, 299–315.e298. [CrossRef] [PubMed]

38. Zagato, E.; Pozzi, C.; Bertocchi, A.; Ssiopa, T. ; Saccheri, F.; Guglietta, S.; Fosso, B. ; Melocchi, L. ; Nizzoli, G. ; Troisi, J. Cosnaíonn ball microbiota murine ingenous Faecalibaculum rodentium agus a homalóg daonna ó fhás siadaí intestinal. Nát. Micribhiol. 2020, 5, 511–524. [CrossRef] [PubMed]

39. Mao, G. ; Li, S.; Orfila, C. ; Sheáin, X. ; Zhou, S.; Linhardt, RJ; Sea, X.; Chen, S. Depolymerized RG-I-saibhrithe peictin ó seicní deighleog citris a mhodhnú microbiota gut, méadaíonn táirgeadh SCFA, agus cuireann sé fás Bifidobacterium spp., Lactobacillus spp. agus Faecalibaculum spp. Feidhm Bia. 2019, 10, 7828–7843. [CrossRef]

40. Miranda, PM; De Palma, G.; Serkis, V. ; Lu, J. ; Louis-Auguste, MP; McCarville, JL; Verdu, EF; Ó Coileáin, SM; Bercik, P. Méadaíonn aiste bia ard salainn colitis i lucha trí leibhéil Lactobacillus agus táirgeadh butyrate a laghdú. Micribhithóim 2018, 6, 57. [CrossRef]

41. Chen, L. ; sé, FJ; Dong, Y. ; Huang, Y. ; Wang, C. ; Harshfield, GA; Zhu, H. Méaduithe measartha ar laghdú sóidiam a scaiptear aigéid shailleacha gearrshlabhra i hipirtheannas neamhchóireáilte: Triail randamach, dall dúbailte, faoi rialú phlaicéabó. Hipirtheannas 2020, 76, 73–79. [CrossRef] [PubMed]

42. Lukovac, S.; Belzer, C. ; Pellis, L. ; Keijser, BJ; de Vos, WM; Montijn, RC; Roeselers, G. Modhnú difreálach ag Akkermansia muciniphila agus Faecalibacterium prausnitzii de mheitibileacht óstach lipid imeallach agus aicéitiliú histone in orgánaigh gut luiche. MBio 2014, 5, agus01438-14. [CrossRef] [PubMed]

43. Dao, MC; Everard, A. ; Aron-Wisnewsky, J.; Sokolovska, N.; Príomhti, E. ; Verger, EO; Kayser, BD; Levenez, F.; Chilloux, J. ; Hoyles, L. Akkermansia muciniphila agus sláinte meitibileach feabhsaithe le linn idirghabhála aiste bia i otracht: Gaol le saibhreas agus éiceolaíocht microbiome gut. Gut 2016, 65, 426–436. [CrossRef] [PubMed]

44. Llewellyn, SR; Britton, GJ; Contijoch, EJ; Vennaro, OH; Mortha, A. ; Colombel, J.-F.; Grinspan, A. ; Clemente, JC; Merad, M.; Faith, JJ Athraítear tréscaoilteacht stéigeach agus déine colitis i lucha mar gheall ar idirghníomhaíochtaí idir aiste bia agus an miocróib stéigeach. Gaistreintreolaíocht 2018, 154, 1037–1046.e1032. [CrossRef]

45. Berber, K. ; Gerdes, LA; Cekanaviciute, E.; Jia, X. ; Xiao, L.; Xia, Z.; Liu, C. ; Klotz, L.; Stauffer, U. ; Cuireann Baranzini, SE Gut microbiota ó othair scléaróis iolrach ar chumas einceifilíteas autoimmune spontáineach i lucha. Proc. Natl. Acad. Sci. Stáit Aontaithe Mheiriceá 2017, 114, 10719–10724. [CrossRef]

46. ​​Sanchez, JMS; DePaula-Silva, AB; Libbey, JE; Fujinami, RS Ról an aiste bia maidir le micribhiota an phutóige agus scléaróis iolrach a rialáil. Clin. Imdhíonól. 2022, 235, 108379. [CrossRef]

47. Mak, IW; Evaniew, N.; Ghert, M. Lost in translation: Samhlacha ainmhithe agus trialacha cliniciúla i gcóireáil ailse. Táim. J. Aistrigh. Res. 2014, 6, 114.

48. Payne, KJ; Crooks, GM Tiomantas lineage imdhíonachta-ceall: Aistriú ó lucha go daoine. Díolúine 2007, 26, 674–677. [CrossRef]

49. Seok, J. ; Warren, HS; Cuenca, AG; Mindrinos, MN; Báicéir, HV; Xu, W. ; Richards, DR; McDonald-Smith, Dochtúir Teaghlaigh; Gao, H.; Hennessy, L. Léiríonn freagraí géanómacha i múnlaí luiche go dona galair athlastacha an duine. Proc. Natl. Acad. Sci. Stáit Aontaithe Mheiriceá 2013, 110, 3507–3512. [CrossRef] [PubMed]

50. Nguyen, TLA; Vieira-Silva, S.; Liston, A. ; Raes, J. Cé chomh faisnéiseach atá an luch le haghaidh taighde ar mhicribhiota putóige daonna? Dis. Mionsamhail. Meicneoir. 2015, 8, 1–16. [CrossRef]

51. Rosshart, SP; Vassallo, BG; Angeletti, D.; Hutchinson, DS; Morgan, AP; Tóga, K. ; Hickman, HD; McCulloch, JA; Broc, JH; Cuireann Ajami, NJ Wild mouse gut microbiota chun cinn folláine óstach agus feabhsaíonn sé friotaíocht galair. Cill 2017, 171, 1015–1028.e1013. [CrossRef] [PubMed]

52. Suzuki, TA; Pifer-Rixey, M.; Mack, KL; Sheehan, MJ; Lín, D.; Bi, K.; Nachman, MW Óstach deitéarmanaint ghéiniteach mhicribhiota gut lucha fiáine. Mol. Éacla. 2019, 28, 3197–3207. [CrossRef] [PubMed]

53. Muiris, CF; CL Knowles, S.; Ladau, J. ; Pollard, KS; Fenton, A. ; Pedersen, AB; Turnbaugh, PJ Athrú séasúrach marcáilte i micribiota gut na luiche fiáin. ISME J. 2015, 9, 2423–2434. [CrossRef] [PubMed]

54. Rosshart, SP; Herz, J.; Vassallo, BG; Hunter, A. ; Balla, MK; Broc, JH; McCulloch, JA; Anastasia, DG; Sarshad, AA; Leonardi, I. Tá micreabhiota nádúrtha ag lucha saotharlainne a rugadh do lucha fiáine agus múnlaíonn siad freagraí imdhíonachta daonna. Eolaíocht 2019, 365, eaaw4361. [CrossRef] [PubMed]

55. Hild, B. ; Dreier, MS; Ó, JH; McCulloch, JA; Broc, JH; Guo, J.; Thefaine, CE; Umarova, R.; Halla, KD; Gavrilova, O. Cosnaíonn nochtadh nuabheirthe do mhicribhithóim atá díorthaithe ón bhfiáin lucha in aghaidh murtall a tharchuirtear le aiste bia. Nát. Metab. 2021, 3, 1042–1057. [CrossRef] [PubMed]

56. Caporaso, JG; Lauber, CL; Walters, WA; Berg-Lyons, D.; Lozupon, CA; Turnbaugh, PJ; Fierer, N. ; Knight, R. Patrúin dhomhanda ar éagsúlacht 16S rRNA ag doimhneacht na milliúin seicheamh in aghaidh an tsampla. Proc. Natl. Acad. Sci. Stáit Aontaithe Mheiriceá 2011, 108, 4516–4522. [CrossRef] [PubMed]

57. Bolyen, E. ; Rideout, JR; Dillon, MR; Bokulich, NA; Abnet, CC; Al-Ghalith, GA; Alastar, H. ; Alm, EJ; Arumugam, M. ; Asnicar, F. Eolaíocht sonraí micribhithóim atá in-atáirgthe, idirghníomhach, inscálaithe agus insínte ag baint úsáide as QIIME 2. Nat. Biteicneolaíocht. 2019, 37, 852–857. [CrossRef]

58. Callahan, BJ; McMurdie, PJ; Rosen, MJ; Han, AW; Johnson, AJA; Holmes, SP DADA2: Tátal samplach ardtaifigh ó shonraí aimplicon Illumina. Nát. Modhanna 2016, 13, 581–583. [CrossRef]

59. Lozupon, C. ; Lladser, ME; Ridirí, D.; Stombaugh, J. ; Knight, R. UniFrac: Fadmhéadrach éifeachtach chun comparáid a dhéanamh idir pobail mhiocróbach. ISME J. 2011, 5, 169–172. [CrossRef]

60. Oksanen, J. ; Simpson, G. ; Blanchet, F. ; Kindt, R. ; Finscéalta, P. ; Minchín, P. ; O'Hara, R.; Solimos, P. ; Stevens, M.; Szoecs, E.; et al. Vegan: Pacáiste Éiceolaíochta Pobail. Leagan 2.6-4. 11 Deireadh Fómhair 2022. Ar fáil ar líne: https://CRAN.R-project.org/package= vegan (ar rochtain an 26 Samhain 2022).

61. Segata, N. ; Izard, J. ; Waldron, L. ; Gevers, D.; Miropolsky, L.; Garrett, WS; Huttenhower, C. Fionnachtain agus míniú bithmharcála metagenomic. Géanóim Biol. 2011, 12, R60. [CrossRef]

62. Dubhghlas, GM; Maffei, VJ; Zaneveld, JR; Yurgel, SN; Donn, JR; Taylor, CM; Huttenhower, C.; Langille, MG PICRUSt2 chun feidhmeanna meiteiginóim a thuar. Nát. Biteicneolaíocht. 2020, 38, 685–688. [CrossRef]

63. Neal, B. ; Wu, Y.; Feng, X. ; Zhang, R.; Zhang, Y.; Shi, J. ; Zhang, J.; Tian, ​​M. ; Huang, L. ; Li, Z. Éifeacht ionadú salainn ar imeachtaí cardashoithíoch agus bás. N. Béarla. J. Med. 2021, 385, 1067–1077. [CrossRef]

64. Arroyo Hornero, R .; Hamad, I. ; Côrte-Real, B.; Kleinewietfeld, M. Tionchar na gcomhpháirteanna aiste bia ar chealla T rialála agus galair. Tosaigh. Imdhíonól. 2020, 11, 253. [CrossRef] [PubMed]

65. Wu, GD; Chen, J.; Hoffmann, C.; Bitinger, K. ; Chen, BB; Cill Baugh, SA; Bewtra, M.; Ridirí, D.; Walters, WA; Ridire, R. ; et al. Patrúin chothaithe fadtéarmacha a nascadh le heintitíopaí miocróbacha gut. Eolaíocht 2011, 334, 105–108. [CrossRef] [PubMed]

66. Ju, T. ; Cong, JY; Stothard, P. ; Toilteanach, BP Ról Parasutterella a shainiú, ball nár aithníodh roimhe seo den chroí-mhicrobiota gut. ISME J. 2019, 13, 1520–1534. [CrossRef] [PubMed]