Staidéar Cógaseolaíochta Líonra ar éifeacht cosúil le estrogenic glycosides de Cistanche Deserticola
Apr 22, 2025
Teiste
Scrúdaíonn an staidéar seo an mheicníocht fhéideartha a bhaineann le héifeachtaí cosúil le estrogenicgliocóisídí deCistanche Deserticola(GCS)Bunaithe ar chógaseolaíocht líonra in éineacht le sonraí athscríofa. Iomlán de40 comhábhar gníomhachtuartha go raibh GCanna le héifeachtaí estrogenic ag baint úsáide as bunachair shonraí marTCMSP, Cuisneoir, Srl, Aimsigh túch a fháil, agusQcharr.
Fuarthas an spriocfhaisnéis ar ghalair easnaimh estrogenic óCártaí giniúnaisUimhriúilBunachair sonraí. Scrúdaíodh príomhspriocanna, agus aLíonra PPItógadh é.Téigh anailís saibhrithe feidhmeisAnailís saibhrithe cosáin Keggrinneadh iad chun príomhspriocanna agus cosáin a aithint.
In éineacht le réamh-shonraí tras-athscríofa, rinneadh anailís chomhghaoil idir spriocanna réamh-mheasta cógaseolaíochta líonra agus cosán KEGG chun meicníocht an éifeacht Estrogenic cosúil le GCS a nochtadh.
183 spriocscrúdaíodh iad, agus1,712 spriocroghnaíodh iad le haghaidh galair easnaimh estrogen.
24 príomhspriocanna lárnachafuarthas.
Léirigh GO Feidhm agus Saibhriú Conair Kegg go ngníomhaíonn GCS den chuid is mó ar phróisis bhitheolaíocha amhail:
Gabhdóir cytokine ceangailteach
Ceangailteach gabhdóra estrogen
Gabhdóir fachtóra fáis ceangailteach
Gníomhaíocht gabhdóra núicléach
Gabhdóir hormóin núicléach ceangailteach
Gníomhaíocht gabhdóra hormóin steroid
Ceangailteach gabhdóra hormóin
I measc na gcosán rialála tá:
Conair chomharthaíochta fachtóir neacróis meall (TNF)
Interleukin -17 (IL {-17) Conair chomharthaíochta
Fachtóir hypoxia-inducible -1 (hif {-1) Conair chomharthaíochta
Conair chomharthaíochta estrogen
Braitheadh athruithe ar léiriú géine ar fad24 sprioc lárnachaseachasMCL1isGCG. Géinte a chuirtear in iúl go héagsúil san áireamhTra, CasP8, ESR1, Fa, agusHmox1. Iomlán de68 Conair Keggaithníodh, leis anConair chomharthaíochta estrogen, Conair chomharthaíochta campa, agusConair chomharthaíochta TNFa bheith ar na príomhbhealaí.
Deireadh
Gliocóisídí deCistanche DeserticolaIs féidir leis éifeachtaí cosúil le estrogen a chur i bhfeidhm trí mheicníocht "il-chomhpháirt, il-sprioc, il-phathbhealach". Féadfaidh an mheicníocht seo a bheith bainteach le rialáil:
Conair chomharthaíochta estrogen
Conair chomharthaíochta campa
Conair chomharthaíochta TNF
Pills sliocht nádúrtha cistanche in ionadEstromimetic
Whatsapp linn le haghaidh tuilleadh sonraí
Eochairfhocail
Gliocóisídí deCistanche Deserticola
Estromimetic
Cógaseolaíocht líonra
Athscríbhinn
Comh -anailís
ÉastraiginIs hormón riachtanach é i bhforbairt an chórais atáirgthe ban agus tréithe gnéis tánaisteacha, ag imirt ról ríthábhachtach maidir le tréithe torthúlachta agus inscne na mban a rialáil [1]. Tar éis dóibh an sos míostraithe a chur isteach, bíonn laghdú ar fheidhm ubhagánach ag mná, rud a fhágann go bhfuil táirgeadh estrogen laghdaithe, rud a chruthaíonn sraith coinníollacha mar oistéapóróis, Atherosclerosis, Siondróm Menopausal, agus galar croí corónach [2]. Is féidir le teiripe athsholáthair estrogen thraidisiúnta na hairíonna de bharr easnamh estrogen a mhaolú nó a laghdú, ach d'fhéadfadh fo -iarsmaí féideartha a bheith mar thoradh ar an gcóireáil seo [3]. Tá sé léirithe ag staidéir go bhféadfadh iomadú iomarcach an endometrium, na fibroids útarach, agus hipearpláis mhamach a bheith mar thoradh ar úsáid fhadtéarmach estrogen, i measc éifeachtaí díobhálacha eile. Dá bhrí sin, tá tábhacht agus luach mór ag lorg cóireáil éifeachtach, sábháilte agus phraiticiúil chun leibhéil ísle estrogen a fheabhsú [4].
Is substaintí iad estrogens plandaí atá in ann gníomhaíocht cosúil le estrogen a chur i bhfeidhm. Tá a struchtúr móilíneach cosúil leis an struchtúr móilíneach atá ag estrogen mhamaigh, rud a chuireann ar a gcumas ceangal sonrach a dhéanamh le gabhdóirí estrogen agus éifeachtaí éadroma cosúil le estrogen a tháirgeadh [5]. Tugann taighde le fios go bhfuil éifeachtaí cógaseolaíochta éagsúla ag estrogens plandaí, lena n-áirítear frith-oistéapóróis agus neamhoird mheitibileacha a athrú [6].
Cistanche DeserticolaAn bhfuil an gas triomaithe, méithe le duilleoga scaly den ghléasra orobanchaceaeCistanche deserticola yc ma. Tá feidhmeanna ann mar thonú duáin Yang, croílár agus fuil a shaibhriú, agus na hinstines a thaisriú chun an mhaolú a mhaolú. Úsáidtear é go coitianta chun easnamh, croílár agus easnamh fola, neamhthorthúlacht, tinneas agus laige an choim agus na glúine a chóireáil, agus an t -easnamh de bharr triomacht intestinal [7]. Dheimhnigh staidéir roimhe seo ag an ngrúpa taighde go raibh gliocóisídí iomlána deCistanche Deserticola(GCS), le hábhar de níos mó ná 60% de echinacoside, is iad na príomh-chomhpháirteanna gníomhacha atá freagrach as a éifeachtaí cosúil le estrogen. Méadaíonn GCanna go mór an chomhéifeacht útarach agus airde na gceall epithelial endometrial i bhfrancaigh neamhaibí. Léirigh torthaí anailíse tras-athscríofa go bhfeidhmíonn GCS éifeachtaí cosúil le estrogen trí 2,953 géinte a cuireadh in iúl go héagsúil, a ndearnadh 1,475 díobh a ghreamú agus go ndearnadh 1,478 a ísliú. Baineann na géinte seo go príomha le freagairt estrogen, rialáil dhearfach ar phróisis mheitibileacha cumaisc nítrigine, próisis fhorbartha, agus rialachán próisis bhitheolaíoch. Glacann siad páirt go príomha saConair chomharthaíochta estrogen, Conair chomharthaíochta campa, RAP1 Conair chomharthaíochta, agusConair chomharthaíochta MAPK [8-9].
Is féidir le cógaseolaíocht líonra Leigheas Traidisiúnta na Síne (TCM) meicníochtaí TCM i gcóireáil galair a fhiosrú trí chomhpháirteanna TCM a scagadh, na próitéiní sprice de chomhpháirteanna gníomhacha a thuar, agus anailís a dhéanamh ar na cosáin chomharthaíochta a bhaineann leis na spriocphróitéiní seo [10-12]. Chun meicníocht na n-éifeachtaí Estrogen atá cosúil le Estrogen a nochtadh a thuilleadh, úsáideann an staidéar seo anailís bithfhaisnéisíochta bunaithe ar shonraí tras-scríbhinní roimhe seo an ghrúpa chun an mheicníocht fhéideartha a nochtadh faoina bhfuil iomlán anngliocóisídí deCistanche Deserticola éifeachtaí cosúil le estrogen a fheidhmiú.
1. Bunachair Sonraí agus Bogearraí Turgnamhacha
TCMSP: http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php
Cuisneoir: https://www.symmap.org
Srl: http://www.nrc.ac.cn:9090/etcm/
Aimsigh túch a fháil: http://stitch.embl.de/
Qcharr: http://targetnet.scbdd.com/
Pubchem: https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov
Uniprot: http://www.uniprot.org/
Cártaí giniúna: http://www.genecards.org/
Uimhriúil: https://www.omim.org/
Téad: https://string-db.org/
Coctra: https://www.kegg.jp/
Bheith ag gabháil: http://geneontology.org/
R teanga: Rx 64 3. 5.3 leis na pacáistí seo a leanas:
Venndiagram
comhaireamh.R
cnuasachprófóir
org.hs.eg.db
siombail2ID
Script perl: addsymbol.pl
Cíteasópe: Leagan 3.7.1
2. Modhanna Turgnamhacha
2.1 Tuar Cógaseolaíocht Líonra ar Mheicníocht cosúil le estrogen GCS
2.1.1 Tuar spriocanna príomh -chomhpháirteanna gníomhacha GCS
Ag baint úsáide as anailís UPLC/Q-TOF-MS, aithníodh 40 comhdhúil le gníomhaíocht chógaseolaíoch cosúil le estrogen [13]. Cuardaíodh na comhdhúile seo iTCMSP, Cuisneoir, agusSrlBunachair sonraí chun spriocanna géine féideartha a aimsiú do gach comhdhúil. Ina theannta sin, allmhairíodh struchtúir aoibh gháire cumaisc isteachAimsigh túch a fháilisQcharrBunachair sonraí chun spriocanna a bhailiú. Rinneadh na spriocanna bailithe go léir a chumasc, agus baineadh dúblach chun próitéiní sprice féideartha a fháil.
2.1.2 Faisnéis faoi bhunachar sonraí sprice estrogen-mhaith
Baineadh úsáid as na heochairfhocail "easnamh estrogen" chun spriocanna ábhartha a chuardach saCártaí giniúnaisUimhriúilBunachair sonraí.
2.1.3 Tógáil an Líonra "Comhdhúil Gníomhach - Sprioc Croí - Estrogen" cosúil le Estrogen "
Ag baint úsáide as anVenndiagramPacáiste i R, rinneadh crosbhealach na spriocanna ón dá fhoinse a bhreacadh mar léaráid Venn. Iompórtáladh sonraí idirghníomhaíochta próitéine iarrthóra isteachCytoscape v3.9.1, agus aithníodh spriocanna lárnacha. Roghnaíodh comhdhúile comhfhreagracha na bpríomhspriocanna, agus rinneadh anailís amhairc ar an líonra “Comhdhúil - Croí -Sprioc - Estrogen”Cytoscape v3.9.1.
2.1.4 Tógáil an Líonra PPI
Iompórtáladh an croí -sprioc -sprioc -sprioc isteach saTéad database, selecting the species "Homo sapiens" and setting the confidence score to >{0. 7 Chun an líonra idirghníomhaíochta próitéine-próitéine (PPI) a thógáil. Ancomhaireamh.RBaineadh úsáid as an bpacáiste i R chun anailís a dhéanamh agus na 20 croí -ghéint is fearr a roghnú agus a roghnú leis an nascacht is airde i measc na bpróitéiní lár -sprioc, a léiríodh.
2.1.5 Anailís Saibhrithe Feidhme agus Anailís Saibhrithe Conair Kegg
Maidir le croí -ghéinte sprice, rinneadh cuardaigh bunachar sonraí GO agus KEGG ag úsáid na bpacáistí Rorg.hs.eg.db, siombail2ID, aguscnuasachprófóir. Rinneadh na 20 conair is fearr le p-luachanna ceartaithe a shamhlú mar bharrachairteacha, ag déanamh anailíse ar na nótaí agus ar na conairí feidhmiúla suntasacha a bhí saibhrithe ag croí-spriocanna éifeachtaí cosúil le estrogen GCS.
2.2 Comhtháthú le Sonraí Athscríofa
2.2.1 Anailís ar chomhghaol idir spriocanna réamh -mheasta agus géinte trascríofacha
Ós rud é go bhfuil na speicis i réamh -mheastacháin chógaseolaíochta líonra daonna, rinneadh na spriocanna a thiontú ina ngéinte francach homalógacha ag úsáidHGNCtríd an bhfeidhm "Tools-HCOP". Rinneadh anailís ar leibhéil léirithe na ngéinte difreálacha idir an grúpa GCS agus an grúpa rialaithe i seicheamhú trascríofa [9].
2.2.2 Anailís ar chomhghaol idir réamh -mheastacháin chógaseolaíochta líonra agus cosáin kegg trascríofa
Cuardaíodh na croí -ghéinte sprice a thuar ag cógaseolaíocht líonra (arna n -athrú go géinte homalógacha francach) i mbunachar sonraí KEGG ag baint úsáide as na pacáistí Rbithsheoltóiriscnuasachprófóirmar aon leis anid2symbol.plscript. Bhí an speiceas teoranta do "RNO," agus scrúdaíodh cosáin le padjust <0. 05. Rinneadh anailís Venn chun conairí forluiteacha a aithint idir conairí KEGG a shaibhríodh trí réamh-mheastacháin chógaseolaíochta líonra agus trí thurgnaimh athscríofa a bhaineann le héifeachtaí cosúil le estrogen GCS.
